Journal of Plant Biotechnology : eISSN 2384-1397 / pISSN 1229-2818

Table. 1.

Table. 1.

Domain Organization in MADS-box proteins

GENE IDsMADS box DomainPFAM:kboxTransmembrane domainInternal repeat 1 (RPT)Coiled coil regionLow complexity regionUnknown region
PeMADS601-6061-175
PeMADS581-60119-130191-127861-118
175-186131-174
PeMADS571-6089-11961-88
PeMADS569-68149-191308-32369-148
192-246
295-307
247-294324-428
PeMADS551-60141-189 249-25761-140
189-239240-248
258-305
PeMADS541-6061-214
PeMADS534-63100-11164-99
112-125
PeMADS504-6183-9462-82
95-148
PeMADS484-6183-9462-82
95-148
PeMADS474-63100-11164-99
112-125
PeMADS434-6970-149
PeMADS4010-6970-116
PeMADS399-6894-176188-20369-93
117-187
204-226
PeMADS374-63147-16964-146
170-215
PeMADS341-4950-157
PeMADS331-6061-127
PeMADS321-6086-11561-85
116-151
PeMADS311-6061-111
PeMADS301-60221-22661-120
255-357227-254
358-384
PeMADS292-6162-186
PeMADS81-6080-17261-79
173-250
PeMADS71-6061-69
PeMADS61-6072-16561-71
166-210
PeMADS51-6077-16961-76
170-219
PeMADS41-6077-16961-76
170-224
PeMADS383-6281-17263-80
PeMADS361-6078-155157-17261-77
PeMADS31-6075-169174-18561-74
186-222
PeMADS281-6075-14061-74
PeMADS271-6083-18161-82
182-194
PeMADS261-6063-171172-192
PeMADS258-6770-9293-103
PeMADS246-6585-17666-84
177-219
PeMADS231-6085-17161-84
172-228
PeMADS225-5354-74
PeMADS211-6081-173230-25361-80
276-289174-229
254-275
290-301
PeMADS201-60164-18261-163
183-290
PeMADS227-86104-1956-2187-103
196-253
PeMADS191-6080-17261-79
173-222
PeMADS181-6080-17161-79
172-223
PeMADS166-6566-80
PeMADS151-6078-167
PeMADS141-60
PeMADS131-6062-18261-81
163-175
PeMADS121-6077-17261-76
173-246
PeMADS111-6079-17261-78
173-244
PeMADS101-6080-17261-79
173-244
PeMADS91-60264-289107-14261-106
143-263
290-321
J Plant Biotechnol 2019;46:255-73 https://doi.org/10.5010/JPB.2019.46.4.255
© 2019 J Plant Biotechnol