J Plant Biotechnol 2016; 43(4): 450-456
Published online December 31, 2016
https://doi.org/10.5010/JPB.2016.43.4.450
© The Korean Society of Plant Biotechnology
강소미, 강홍규, 선현진, 양대화, 권용익, 고석민
제주대학교 아열대원예산업연구소,
제주대학교 아열대원예산업연구소,
제주대학교 분자생명공학전공
Correspondence to : e-mail: heyna@jejunu.ac.kr
e-mail: hyoyeon@jejunu.ac.kr
This is an Open-Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution Non-Commercial License (http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0) which permits unrestricted non-commercial use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited.
Rhizoctonia leaf blight (large patch) has become a serious problem in Korean lawn grass, which is extremely hard to treat and develops mostly from the roots of lawn grass to wither it away. Rhizoctonia leaf blight (large patch) is caused by Rhizoctonia solani AG2-2 (IV). To develop zoysia japonica with strong disease tolerance against this pathogenic bacterium, β-1,3-glucanase was cloned from zoysia japonica, which is one of the PR-Proteins known to play a critical role in plant defense reaction. β-1,3-glucanase is known to be generated within the cells when plant tissues have a hypersensitive reaction due to virus or bacterium infection and secreted outside the cells to play mainly the function of resistance against pathogenic bacteria in the space between the cells. This study utilized the commonly preserved part in the sequence of corn, wheat, barley, and rice which had been researched for their disease tolerance among the β-1,3-glucanase monocotyledonous plants. Based on the part, degenerate PCR was performed to find out the sequence and full-length cDNA was cloned. E.coli over- expression was conducted in this study to mass purify target protein and implement in vitro activation measurement and antibacterial test. In addition, to interpret the functions of ZjGlu1 gene, each gene-incorporating plant transformation vectors were produced to make lawn grass transformant. Based on ZjGlu1 protein, antibacterial activity test was conducted on 9 strains. As a result, R. cerealis, F. culmorum, R.solani AG-1 (1B), and T. atroviride were found to have antibacterial activity. The gene-specific expression amount in each organ showed no huge difference in the organs based upon the transformant and against 18s gene expression amount.
Keywords Beta-1,3-glucanase, Zoysiagrass, Over-expression, Antibacterial activity
잔디는 화본과 작물로 생육적온에 따라 난지형과 한지형 잔디로 분류된다. 난지형 잔디는 여름철 고온 및 건조에 강한 품종이나, 추위에 약하고 녹기 유지기간이 짧은데 반해, 한지형 잔디는 추위에 강하며 녹도 및 밀도가 높은 장점이 있지만, 고온 및 건조에 취약하여 여름철에는 관리가 까다롭다(Ganesan et al. 2012). 들잔디는 한국을 비롯한 일본, 중국 등 동아시아 지역을 중심으로 매우 중요하게 사용되는 품종이다. 고온 및 건조에 강하고, 병해충에도 잘 견디며 척박한 토양에서도 생육이 왕성하여 골프장, 경기장, 도로법면, 하천제방 등 다양한 곳에 이용되고 있다(Ge et al. 2006; Toyama et al. 2003).
우리나라에서 재배되고 있는 잔디는 들잔디류(
한국형 잔디에는
본 연구에서는 농약 사용량을 저감시키고 곰팡이 병원균에 의한 발병률을 낮추어 방대한 지역의 잔디를 구제하기 위해 PR-protein 중 하나인 β-1,3-glucanase유전자를 클로닝하여 들잔디 형질전환을 위한 검증을 하였다. 더불어,
야외 온실에서 생육된 들잔디(
한국형 들잔디에 존재하는 β-1,3-glucanase 유전자의 분리는 계통학적으로 근연관계가 가까운 단자엽 식물인 옥수수, 밀, 보리, 벼에서 이미 β-1,3-glucanase 유전자들의 기능분석이 되어있는 염기서열을 이용하여 유사성이 높은 부분에서 특이적primer를 제작하였다(Table 1).
Table 1 Gene specific primers used in this study
Use for | Oligo name | Primer sequence |
---|---|---|
Degenerate | Forward | 5’-TCCATCGGCGTVTGCTAYGGC-3′ |
Reverse | 5’-CTGGTTCTCGTTGAACATGGC-3′ | |
3’ RACE | Glu -1 Forward1 | 5′-GAACGTGAAGGTGGTGATCTC-3′ |
Glu - Forward2 | 5′-CTACAACCAGGGGCTGATCAA-3′ | |
dT-ACP1 | 5′-CTGTGAATGCTGCGACTACGATXXXXX(T)18-3′ | |
dT-ACP2 | 5’-CTGTGAATGCTGCGACTACGATXXXXX(T)15-3′ | |
5’RACE | 5’Glu1-RT | 5’-CATACTGATCAAGTG-3′ |
5’Glu1-Forward | 5’-TACTGATCGACGAGCAGTACT-3′ | |
5’Glu-Reverse 1 | 5’-GGGCCCAACAAGGCGGCGCTG-3′ | |
5’Glu-Reverse 2 | 5’-ACGCTGGGCAACAACCTGCCG-3′ | |
GST-fusion vector (pGEX 4T-1) | GLU1_4T-1_F | 5’-GGATCCTCGCTTCTCACAACGGTGCAAT-3’ |
GLU1_4T-1_R | 5’-GCGGCCGCTTAGAAGCGGATGGGGTAGACC-3’ |
들잔디의 total RNA는 ChomczynskiP and SacchiN.1987의 방법에 따라 trizol reagent (MRC,미국)를 이용하여 추출하였으며, 유전자 특이적 프라이머를 이용하여 β-1,3-glucanase 유전자가 분리되었다. 분리된 유전자는 Gene Fishing™ DEG Kits (씨젠, 한국)에 제공된 adaptor서열이 달린 oligo dT primer (Table 1)을 이용하여 cDNA를 합성한 후, pGEM T-easy vector system을 이용하여 β-1,3-glucanase의 full-length cDNA sequence를 얻어냈다.
클로닝이 끝난 β-1,3-glucanase의 아미노산서열을 NCBI에서 blast한 후 상동성이 높은 단자엽과 쌍자엽 식물인
사용한 program은 BioEdit ver 7.7.0 (
식물체는 상토와 모래를 약 5:1로 혼합한 토양에 식재하여 자연채광의 유리온실에 있는 들잔디의 식물체의 flower, blade, sheath, stolon, root에서 total RNA를 추출하였다. DNA-free kit (Ambion,미국)을 사용하여 섞여있는 DNA를 제거한 total RNA에 OligodT primer (dT15)를 0.5 ug 넣고 70°C에서 5분간 가열 한 후 얼음에 식히고, RNasin Ribonuclease inhibitor 25 unit, RTase 200 unit, 5x reaction buffer, dNTP 혼합액을 섞어 42°C에서 90분간 반응시킴으로써 1쇄 cDNA를 합성하였다. RTase는 Promega (미국) 사에서 판매하는 Moloney Murine Leukemia Virus Reverse Transcriptase (M-MLV RT)를 사용하였다.
단백질을 대량정제 하기 위해
얻어진 단백질 추출물을 SDS-PAGE (Sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis)를 수행하여 발현의 유도 및 수용성여부를 판단하였다. 겔의 Acrylamide농도는 Stocking gel 3%, Separation gel 12%로 하였으며 영동 후 0.2% Coomassie brilliant blue R-250 (Sigma, 미국) 용액으로 염색하여 7.5% acetic acid용액으로 탈색 후 단백질을 검출하였다.
재조합 들잔디 β-1,3-glucanase단백질을 정제하기 위해
Alignment of the amino acid sequence of Zoysia japonica β-1,3-glucanase with various plant β-1,3-glucanases. The glycosyl hydrolase motif is marked in blue box
Phylogenetic tree of deduced sequences of β-1,3-glucanase genes from plants. Plyogenetic analysis was generated using MEGA 5.0 by the neighbor -joing method. One gene from zoysia japonica steud. Is shown green diamond
Organ-specific expression of β-1,3-glucanase by RT-PCR. Expression analysis of ZjGlu1 from different organsin zoysiagrass showed higher expression. 18S rRNA was used as loading control
SDS-PAGE and purification of GST- β-1,3-glucanase. Overexpression of GST- β-1,3-glucanase fusion protein in E.coli and purified GST- β-1,3-glucanase fusion protein (ZjGu1). (A) M, protein marker; Lane1, Total protein (+ IPTG); Lane2, Soluble protein (+ IPTG); Lane 3, insoluble protein (+ IPTG); Lane4, Purified GST- β-1,3-glucanase fusion protein. (B) M, protein marker; Lane 1, purified β-1,3-glucanase Protein(ZjGlu1)
Activity of glucanase. (A)Fusarium culmorum, (B) solani AG-1(1B), (C) Trichoderma atroviride, (D) Rhizoctonia cerealis
앞선 실험에서 검토된 조건에 따라 균을 대량으로 배양하고 수집하여 binding buffer (1xPBS, 137 mM NaCl, 2.7 mM KCl, 10 mM Na2HPO4, 2 mM KH2PO4, PH7.4)에 재현탁한 후 Ultrsonication (Sonics & Materials,미국)을 사용하여 용해하였다. 13000 rpm에서 30분간 원심분리하여 불용성의 단백질들을 제거하고 상층액으로부터 Glutathione Sepharose 4 Fast Flow (GE Healthcare, 미국)를 이용하여 GST-tag이 fusion된 β-1,3-glucanase단백질을 정제하였다. 정제 방법은 Glutathione Sepharose 4 Fast Flow (GE Healthcare, 미국)에 있는 procotol을 따랐으며 Elution buffer의 조성은 50 mM Tris-HCl, 10 mM reduced glutathione, pH8.0으로 사용하였다.
디스크 방산법을 이용한 항균활성 검정을 위해 PDA배지에 paper disk를 치상하고 디스크당 정제한 ZjGlu1 단백질을 236 ug과 PBS buffer를 control로 점적 한 후 중앙에 시험균주를 치상하고 25°C에서 암배양 하며 균사의 생장을 관찰하여 항균활성을 비교하였다.
들잔디로부터 β-1,3-glucanase 유전자를 분리하였고,
여러 논문을 통해서 β-1,3-glucanase는 생식기관 및 각기 발달이 다른 다양한 기관에 위치해 있으며 식물 β-1,3-glucanase의 구조와, 발현조절 등 식물에서의 직접적, 간접적으로 아주 많은 역할을 하는 것을 알 수 있다(Claude 2001; Magdalena et al. 2004; Yanlin et al. 2006; Saboki et al. 2011).
한국형 들잔디에서 가장 문제가 되고 있는 라이족토니아잎마름병(라지패취)의 병원균인
재조합 단백질의 항균활성을 검정하기 위해 정제된 ZjGlu1 단백질과
한국형 잔디에서는 다른 병에 비해 진전 속도가 빠르고 주로 뿌리에서부터 발병하여 잔디를 고사시키고 발병 후 구제하기 매우 어려운 라이족토니아잎마름병(라지패취)이 큰 문제로 대두되고 있다. 라이족토니아잎마름병(라지패취)은
이 논문은 2016년도 정부(교육부)의 재원으로 한국연구재단의 지원을 받아 수행된 기초연구사업임(2016R1A6A1A03012862).
본 연구는 농촌진흥청 차세대바이오그린사업(과제번호 PJ01186001)의 지원을 받아 수행 되었음.
J Plant Biotechnol 2016; 43(4): 450-456
Published online December 31, 2016 https://doi.org/10.5010/JPB.2016.43.4.450
Copyright © The Korean Society of Plant Biotechnology.
강소미, 강홍규, 선현진, 양대화, 권용익, 고석민
제주대학교 아열대원예산업연구소,
제주대학교 아열대원예산업연구소,
제주대학교 분자생명공학전공
So-Mi Kang, Hong-Gyu Kang, Hyeon-Jin Sun, Dae-Hwa Yang, Yong-Ik Kwon, Suk-Min Ko
Subtropical Horticulture Research Institute, Jeju National University, Jeju, 63243, Republic of Korea,
Omicsis. Inc. (BVC, Korea Research Institute of Bioscience & Biotechnology, Daejeon 34141, Korea,
Subtropical Horticulture Research Institute, Jeju National University, Jeju, 63243, Republic of Korea,
Faculty of Biotechnology, Jeju National University, jeju 63243, Korea
Correspondence to: e-mail: heyna@jejunu.ac.kr
e-mail: hyoyeon@jejunu.ac.kr
This is an Open-Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution Non-Commercial License (http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0) which permits unrestricted non-commercial use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited.
Rhizoctonia leaf blight (large patch) has become a serious problem in Korean lawn grass, which is extremely hard to treat and develops mostly from the roots of lawn grass to wither it away. Rhizoctonia leaf blight (large patch) is caused by Rhizoctonia solani AG2-2 (IV). To develop zoysia japonica with strong disease tolerance against this pathogenic bacterium, β-1,3-glucanase was cloned from zoysia japonica, which is one of the PR-Proteins known to play a critical role in plant defense reaction. β-1,3-glucanase is known to be generated within the cells when plant tissues have a hypersensitive reaction due to virus or bacterium infection and secreted outside the cells to play mainly the function of resistance against pathogenic bacteria in the space between the cells. This study utilized the commonly preserved part in the sequence of corn, wheat, barley, and rice which had been researched for their disease tolerance among the β-1,3-glucanase monocotyledonous plants. Based on the part, degenerate PCR was performed to find out the sequence and full-length cDNA was cloned. E.coli over- expression was conducted in this study to mass purify target protein and implement in vitro activation measurement and antibacterial test. In addition, to interpret the functions of ZjGlu1 gene, each gene-incorporating plant transformation vectors were produced to make lawn grass transformant. Based on ZjGlu1 protein, antibacterial activity test was conducted on 9 strains. As a result, R. cerealis, F. culmorum, R.solani AG-1 (1B), and T. atroviride were found to have antibacterial activity. The gene-specific expression amount in each organ showed no huge difference in the organs based upon the transformant and against 18s gene expression amount.
Keywords: Beta-1,3-glucanase, Zoysiagrass, Over-expression, Antibacterial activity
잔디는 화본과 작물로 생육적온에 따라 난지형과 한지형 잔디로 분류된다. 난지형 잔디는 여름철 고온 및 건조에 강한 품종이나, 추위에 약하고 녹기 유지기간이 짧은데 반해, 한지형 잔디는 추위에 강하며 녹도 및 밀도가 높은 장점이 있지만, 고온 및 건조에 취약하여 여름철에는 관리가 까다롭다(Ganesan et al. 2012). 들잔디는 한국을 비롯한 일본, 중국 등 동아시아 지역을 중심으로 매우 중요하게 사용되는 품종이다. 고온 및 건조에 강하고, 병해충에도 잘 견디며 척박한 토양에서도 생육이 왕성하여 골프장, 경기장, 도로법면, 하천제방 등 다양한 곳에 이용되고 있다(Ge et al. 2006; Toyama et al. 2003).
우리나라에서 재배되고 있는 잔디는 들잔디류(
한국형 잔디에는
본 연구에서는 농약 사용량을 저감시키고 곰팡이 병원균에 의한 발병률을 낮추어 방대한 지역의 잔디를 구제하기 위해 PR-protein 중 하나인 β-1,3-glucanase유전자를 클로닝하여 들잔디 형질전환을 위한 검증을 하였다. 더불어,
야외 온실에서 생육된 들잔디(
한국형 들잔디에 존재하는 β-1,3-glucanase 유전자의 분리는 계통학적으로 근연관계가 가까운 단자엽 식물인 옥수수, 밀, 보리, 벼에서 이미 β-1,3-glucanase 유전자들의 기능분석이 되어있는 염기서열을 이용하여 유사성이 높은 부분에서 특이적primer를 제작하였다(Table 1).
Table 1 . Gene specific primers used in this study.
Use for | Oligo name | Primer sequence |
---|---|---|
Degenerate | Forward | 5’-TCCATCGGCGTVTGCTAYGGC-3′ |
Reverse | 5’-CTGGTTCTCGTTGAACATGGC-3′ | |
3’ RACE | Glu -1 Forward1 | 5′-GAACGTGAAGGTGGTGATCTC-3′ |
Glu - Forward2 | 5′-CTACAACCAGGGGCTGATCAA-3′ | |
dT-ACP1 | 5′-CTGTGAATGCTGCGACTACGATXXXXX(T)18-3′ | |
dT-ACP2 | 5’-CTGTGAATGCTGCGACTACGATXXXXX(T)15-3′ | |
5’RACE | 5’Glu1-RT | 5’-CATACTGATCAAGTG-3′ |
5’Glu1-Forward | 5’-TACTGATCGACGAGCAGTACT-3′ | |
5’Glu-Reverse 1 | 5’-GGGCCCAACAAGGCGGCGCTG-3′ | |
5’Glu-Reverse 2 | 5’-ACGCTGGGCAACAACCTGCCG-3′ | |
GST-fusion vector (pGEX 4T-1) | GLU1_4T-1_F | 5’-GGATCCTCGCTTCTCACAACGGTGCAAT-3’ |
GLU1_4T-1_R | 5’-GCGGCCGCTTAGAAGCGGATGGGGTAGACC-3’ |
들잔디의 total RNA는 ChomczynskiP and SacchiN.1987의 방법에 따라 trizol reagent (MRC,미국)를 이용하여 추출하였으며, 유전자 특이적 프라이머를 이용하여 β-1,3-glucanase 유전자가 분리되었다. 분리된 유전자는 Gene Fishing™ DEG Kits (씨젠, 한국)에 제공된 adaptor서열이 달린 oligo dT primer (Table 1)을 이용하여 cDNA를 합성한 후, pGEM T-easy vector system을 이용하여 β-1,3-glucanase의 full-length cDNA sequence를 얻어냈다.
클로닝이 끝난 β-1,3-glucanase의 아미노산서열을 NCBI에서 blast한 후 상동성이 높은 단자엽과 쌍자엽 식물인
사용한 program은 BioEdit ver 7.7.0 (
식물체는 상토와 모래를 약 5:1로 혼합한 토양에 식재하여 자연채광의 유리온실에 있는 들잔디의 식물체의 flower, blade, sheath, stolon, root에서 total RNA를 추출하였다. DNA-free kit (Ambion,미국)을 사용하여 섞여있는 DNA를 제거한 total RNA에 OligodT primer (dT15)를 0.5 ug 넣고 70°C에서 5분간 가열 한 후 얼음에 식히고, RNasin Ribonuclease inhibitor 25 unit, RTase 200 unit, 5x reaction buffer, dNTP 혼합액을 섞어 42°C에서 90분간 반응시킴으로써 1쇄 cDNA를 합성하였다. RTase는 Promega (미국) 사에서 판매하는 Moloney Murine Leukemia Virus Reverse Transcriptase (M-MLV RT)를 사용하였다.
단백질을 대량정제 하기 위해
얻어진 단백질 추출물을 SDS-PAGE (Sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis)를 수행하여 발현의 유도 및 수용성여부를 판단하였다. 겔의 Acrylamide농도는 Stocking gel 3%, Separation gel 12%로 하였으며 영동 후 0.2% Coomassie brilliant blue R-250 (Sigma, 미국) 용액으로 염색하여 7.5% acetic acid용액으로 탈색 후 단백질을 검출하였다.
재조합 들잔디 β-1,3-glucanase단백질을 정제하기 위해
Alignment of the amino acid sequence of Zoysia japonica β-1,3-glucanase with various plant β-1,3-glucanases. The glycosyl hydrolase motif is marked in blue box
Phylogenetic tree of deduced sequences of β-1,3-glucanase genes from plants. Plyogenetic analysis was generated using MEGA 5.0 by the neighbor -joing method. One gene from zoysia japonica steud. Is shown green diamond
Organ-specific expression of β-1,3-glucanase by RT-PCR. Expression analysis of ZjGlu1 from different organsin zoysiagrass showed higher expression. 18S rRNA was used as loading control
SDS-PAGE and purification of GST- β-1,3-glucanase. Overexpression of GST- β-1,3-glucanase fusion protein in E.coli and purified GST- β-1,3-glucanase fusion protein (ZjGu1). (A) M, protein marker; Lane1, Total protein (+ IPTG); Lane2, Soluble protein (+ IPTG); Lane 3, insoluble protein (+ IPTG); Lane4, Purified GST- β-1,3-glucanase fusion protein. (B) M, protein marker; Lane 1, purified β-1,3-glucanase Protein(ZjGlu1)
Activity of glucanase. (A)Fusarium culmorum, (B) solani AG-1(1B), (C) Trichoderma atroviride, (D) Rhizoctonia cerealis
앞선 실험에서 검토된 조건에 따라 균을 대량으로 배양하고 수집하여 binding buffer (1xPBS, 137 mM NaCl, 2.7 mM KCl, 10 mM Na2HPO4, 2 mM KH2PO4, PH7.4)에 재현탁한 후 Ultrsonication (Sonics & Materials,미국)을 사용하여 용해하였다. 13000 rpm에서 30분간 원심분리하여 불용성의 단백질들을 제거하고 상층액으로부터 Glutathione Sepharose 4 Fast Flow (GE Healthcare, 미국)를 이용하여 GST-tag이 fusion된 β-1,3-glucanase단백질을 정제하였다. 정제 방법은 Glutathione Sepharose 4 Fast Flow (GE Healthcare, 미국)에 있는 procotol을 따랐으며 Elution buffer의 조성은 50 mM Tris-HCl, 10 mM reduced glutathione, pH8.0으로 사용하였다.
디스크 방산법을 이용한 항균활성 검정을 위해 PDA배지에 paper disk를 치상하고 디스크당 정제한 ZjGlu1 단백질을 236 ug과 PBS buffer를 control로 점적 한 후 중앙에 시험균주를 치상하고 25°C에서 암배양 하며 균사의 생장을 관찰하여 항균활성을 비교하였다.
들잔디로부터 β-1,3-glucanase 유전자를 분리하였고,
여러 논문을 통해서 β-1,3-glucanase는 생식기관 및 각기 발달이 다른 다양한 기관에 위치해 있으며 식물 β-1,3-glucanase의 구조와, 발현조절 등 식물에서의 직접적, 간접적으로 아주 많은 역할을 하는 것을 알 수 있다(Claude 2001; Magdalena et al. 2004; Yanlin et al. 2006; Saboki et al. 2011).
한국형 들잔디에서 가장 문제가 되고 있는 라이족토니아잎마름병(라지패취)의 병원균인
재조합 단백질의 항균활성을 검정하기 위해 정제된 ZjGlu1 단백질과
한국형 잔디에서는 다른 병에 비해 진전 속도가 빠르고 주로 뿌리에서부터 발병하여 잔디를 고사시키고 발병 후 구제하기 매우 어려운 라이족토니아잎마름병(라지패취)이 큰 문제로 대두되고 있다. 라이족토니아잎마름병(라지패취)은
이 논문은 2016년도 정부(교육부)의 재원으로 한국연구재단의 지원을 받아 수행된 기초연구사업임(2016R1A6A1A03012862).
본 연구는 농촌진흥청 차세대바이오그린사업(과제번호 PJ01186001)의 지원을 받아 수행 되었음.
Alignment of the amino acid sequence of Zoysia japonica β-1,3-glucanase with various plant β-1,3-glucanases. The glycosyl hydrolase motif is marked in blue box
Phylogenetic tree of deduced sequences of β-1,3-glucanase genes from plants. Plyogenetic analysis was generated using MEGA 5.0 by the neighbor -joing method. One gene from zoysia japonica steud. Is shown green diamond
Organ-specific expression of β-1,3-glucanase by RT-PCR. Expression analysis of ZjGlu1 from different organsin zoysiagrass showed higher expression. 18S rRNA was used as loading control
SDS-PAGE and purification of GST- β-1,3-glucanase. Overexpression of GST- β-1,3-glucanase fusion protein in E.coli and purified GST- β-1,3-glucanase fusion protein (ZjGu1). (A) M, protein marker; Lane1, Total protein (+ IPTG); Lane2, Soluble protein (+ IPTG); Lane 3, insoluble protein (+ IPTG); Lane4, Purified GST- β-1,3-glucanase fusion protein. (B) M, protein marker; Lane 1, purified β-1,3-glucanase Protein(ZjGlu1)
Activity of glucanase. (A)Fusarium culmorum, (B) solani AG-1(1B), (C) Trichoderma atroviride, (D) Rhizoctonia cerealis
Table 1 . Gene specific primers used in this study.
Use for | Oligo name | Primer sequence |
---|---|---|
Degenerate | Forward | 5’-TCCATCGGCGTVTGCTAYGGC-3′ |
Reverse | 5’-CTGGTTCTCGTTGAACATGGC-3′ | |
3’ RACE | Glu -1 Forward1 | 5′-GAACGTGAAGGTGGTGATCTC-3′ |
Glu - Forward2 | 5′-CTACAACCAGGGGCTGATCAA-3′ | |
dT-ACP1 | 5′-CTGTGAATGCTGCGACTACGATXXXXX(T)18-3′ | |
dT-ACP2 | 5’-CTGTGAATGCTGCGACTACGATXXXXX(T)15-3′ | |
5’RACE | 5’Glu1-RT | 5’-CATACTGATCAAGTG-3′ |
5’Glu1-Forward | 5’-TACTGATCGACGAGCAGTACT-3′ | |
5’Glu-Reverse 1 | 5’-GGGCCCAACAAGGCGGCGCTG-3′ | |
5’Glu-Reverse 2 | 5’-ACGCTGGGCAACAACCTGCCG-3′ | |
GST-fusion vector (pGEX 4T-1) | GLU1_4T-1_F | 5’-GGATCCTCGCTTCTCACAACGGTGCAAT-3’ |
GLU1_4T-1_R | 5’-GCGGCCGCTTAGAAGCGGATGGGGTAGACC-3’ |
Pham My Hao ・Le Pham Tan Quoc
J Plant Biotechnol 2024; 51(1): 50-54Woo-Nam Kim, In-Ja Song, Hong-Gyu Kang, Hyeon-Jin Sun, Dae-Hwa Yang, Yong-Eok Lee, Yong-Ik Kwon, and Hyo-Yeon Lee
J Plant Biotechnol 2017; 44(3): 220-228
Journal of
Plant BiotechnologyAlignment of the amino acid sequence of Zoysia japonica β-1,3-glucanase with various plant β-1,3-glucanases. The glycosyl hydrolase motif is marked in blue box
|@|~(^,^)~|@|Phylogenetic tree of deduced sequences of β-1,3-glucanase genes from plants. Plyogenetic analysis was generated using MEGA 5.0 by the neighbor -joing method. One gene from zoysia japonica steud. Is shown green diamond
|@|~(^,^)~|@|Organ-specific expression of β-1,3-glucanase by RT-PCR. Expression analysis of ZjGlu1 from different organsin zoysiagrass showed higher expression. 18S rRNA was used as loading control
|@|~(^,^)~|@|SDS-PAGE and purification of GST- β-1,3-glucanase. Overexpression of GST- β-1,3-glucanase fusion protein in E.coli and purified GST- β-1,3-glucanase fusion protein (ZjGu1). (A) M, protein marker; Lane1, Total protein (+ IPTG); Lane2, Soluble protein (+ IPTG); Lane 3, insoluble protein (+ IPTG); Lane4, Purified GST- β-1,3-glucanase fusion protein. (B) M, protein marker; Lane 1, purified β-1,3-glucanase Protein(ZjGlu1)
|@|~(^,^)~|@|Activity of glucanase. (A)Fusarium culmorum, (B) solani AG-1(1B), (C) Trichoderma atroviride, (D) Rhizoctonia cerealis