The Korean Society of Plant Biotechnology
Review
Split Viewer
J Plant Biotechnol 2018; 45(4): 289-298
Published online December 31, 2018
https://doi.org/10.5010/JPB.2018.45.4.289
© The Korean Society of Plant Biotechnology
새로운 생명공학작물 안전성 평가를 위한 작물 성분 DB 구축
김은하, 이성곤, 박수윤, 이상구, 오선우
국립농업과학원 생물안전성과
Development of the conventional crop composition database for new genetically engineered crop safety assessment
Correspondence to : e-mail: ohsw0507@korea.kr
This is an Open-Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution Non-Commercial License (http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0) which permits unrestricted non-commercial use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited.
The Biosafety Division of the National Academy of Agricultural Science has developed a ‘Crop Composition DB’ that provides analytical data on commercialized crops. It can be used as a reference in the ‘Comparative Evaluation by Compositional Analysis’ for the safety assessment of genetically modified (GM) crops. This database provides the composition of crops cultivated in Korea, and thus upgrades the data to check the extent of changes in the compositional content depending on the cultivated area, varieties and year. The database is a compilation of data on the antioxidant, nutrient and secondary metabolite compositions of rice and capsicum grown in two or more cultivation areas for a period of more than two years. Data analysis was conducted under the guidelines of the Association of Official Analytical Chemists or methods previously reported on papers. The data was provided as average, minimum and maximum values to assess whether the statistical differences between the GM crops and comparative non-GM crops fall within the biological differences or tolerances of the existing commercial crops. The Crop Composition DB is an open-access source and is easy to access based on the query selected by the user. Moreover, functional ingredients of colored crops, such as potatoes, sweet potatoes and cauliflowers, were provided so that food information can be used and utilized by general consumers. This paper introduces the feature and usage of ‘Crop Composition DB’, which is a valuable tool for characterizing the composition of conventional crops.
Keywords Crop composition data, Nutrients, Antinutrient, Rice, Capsicum
농업생명공학 기술은 농업 관행에 따른 환경오염 감소와 인구 증가에 따른 식량자원보급 및 영양학적 불균형의 해소와 농민들의 사회 경제적 상황의 향상 등에 대한 가능성을 열어주는 지속적인 발전이 가능한 강력한 도구이다(Ridley et al. 2004). 생명공학 작물(Genetically Modified Crops, GMCs 또는 biotech crops)은 1994년 FlavrSavr 토마토로 처음으로 상업적으로 이용되기 시작하여 1995년-1996년 제초제 내성 및 해충 저항성 대두 및 옥수수 제품이 도입되었다. 이 후로 GM작물에 대한 수요가 증가하면서 GM작물의 재배를 승인하는 국가와 재배 승인되는 작물의 종류가 증가하였다(Aldemita 2015). 결과적으로 1996년 170만
형질전환으로 개발된 GM작물들은 상업화되기 전에 환경 및 인체에 대한 영향을 엄격하게 평가받는 심사절차 과정을 거친다. 안전성 평가의 원칙은 OECD (Organization for Economic Cooperation and Development)에서 처음 제출되었으며(1993), 이 내용은 2003년 국제식량농업기구(FAO)/세계보건기구(WHO)가 설립한 식품규격위원회(Codex)가 제안한 가이드라인을 따르고 있다. GM작물의 안전성 평가방법은 ‘실질적 동등성(substantial equivalence)’ 개념을 근거로 평가되고 있으며(Codex Alimentarius 2003a; 2003b), 이는 GM작물을 기존에 안전하게 사용되어져 온 부모계 또는 근동질유전계와 같은 대응작물(Non-GM comparator)과 전통적으로 재배되어 온 상용 품종과 비교하는 것이다(Kok and Kuiper 2003). 실질적 동등성에 의한 안전성 평가는 절대적 안전성을 의미하는 것은 아니지만 현재로서는 가장 합리적인 접근 방법으로 인정되고 있다. 평가항목으로는 도입된 유전자의 안전성과 이로부터 생산되는 단백질과 대사물질의 안전성, 표현형 및 농업 형질, 성분 분석, 알레르기, 독성, GM작물 재배의 환경 위해성 등이 있다. 성분분석 비교법은 외부 유전자의 도입과정 또는 형질전환 산물에 의한 대사과정의 변경을 통하여 비의도적으로 구성 성분에 변화를 일으켜 상업 작물과 비교하였을 때 잠재적 위해성을 일으킬 수 있다는 가능성으로 시작되었으며, 이후 안전성 평가 과정에서 중요한 토대가 되었다(Burne 2013; Herman and Price 2013).
본 논문은 생명공학 작물 안전성 평가 과정에서 성분분석 비교법에 대하여 알아보고, 이에 기존 상업작물 품종의 자연변이 평가의 근거 자료로 사용될 수 있는 성분분석 자료 확보 및 작물성분 데이터베이스(DB) 구축의 중요성을 강조, 이를 뒷받침하고자 해외의 DB 구축과 활용에 대해 조사하였다. 그리고 우리나라에서 GM작물의 안전성 평가에 활용될 수 있도록 2015년부터 농촌진흥청 국립농업과학원에서 개발한 벼와 고추 등 주요 작물들의 상업화된 품종 성분 DB를 소개하였다. 농촌진흥청 ｢작물성분 DB｣ 구성과 현재 정보가 제공되고 있는 작물성분 내용 및 DB사용법을 안내하고, 향후 DB 활용의 중요성을 제시하였다.
생명공학 작물의 안전성 평가를 위한 기존 상업작물 DB 개발의 필요성
주요성분 비교평가는 작물의 영양 조성에서 GM작물과 대응작물의 실질적 동등성을 가장 빠르고 정확하게, 직접적으로 비교평가하는 항목이다. OECD는 GM작물 안전성 평가에 필요한 분석기준을 정립하고 18개 작물별 분석 성분의 종류와 함량 범위에 대한 국제적인 합의문을 발간하였다. 주요성분 분석은 주요 생화학적 구성 요소의 정량적 측정에 초점이 맞춰져 있으며(OECD 2012; 2016), 이러한 구성 요소로는 지질과 단백질, 회분, 탄수화물, 섬유질로 구성된 일반성분과 아미노산, 지방산, 비타민, 미네랄과 같은 주요영양성분과 작물 특이적인 항영양소와 이차대사산물로써 표적성분에 대한 비교평가이다. 성분비교에 대한 요구 조건은 각 규제당국마다 차이가 있지만, 재배 년 수 및 재배 지역 수, 합당한 비교군, 분석 신뢰성, 통계분석, 그리고 일반재배 작물의 참고범위 정보를 제공하는 것이 일반적이다. 참고자료에 대한 정보는 주로 국제생명과학연구회(International Life Science Institute, ILSI) 작물성분 데이터 또는 전문저널지에 발표된 데이터로 제공할 수 있다. 특히 유럽식품안전청(European Food Safety Authority, EFSA)은 GM작물의 안전성 평가를 위하여 작물의 재배 방법과 재료의 수확, 비교 상업작물의 선정 조건, 통계분석 방법 등에 대한 구체적인 가이드라인을 제시하고 있다(EFSA 2010; 2011a; 2011b; 2011c).
성분 분석 비교법은 GM작물과 대응작물에 존재하는 성분을 비교하는 것으로, 두 작물에 함유된 어떤 성분이 통계학적으로 유의미한 차이가 없다면 GM작물에서 도입된 형질이 비의도적으로 의미 있는 영향을 미치지 않았다고 평가되며, 차후 그 성분에 대한 안전성 평가를 진행하지 않는다. 그러나 통계학적으로 유의미한 차이가 있다면, 두 작물간의 성분 차이가 작물 품종에서 발견되는 자연변이 범위 내에 속해있는지 평가한다. GM작물의 안전성 평가를 위한 기존 상업품종들의 성분데이터는 상업품종들을 GM작물, 대응작물과 함께 재배하여 분석하거나, 발표되어 있는 문헌의 자료나 데이터베이스를 이용한다. 따라서 GM작물의 성분이 상업작물의 자연 변이에 속하는지 비교하기 위하여 포괄적인 최신 성분데이터가 필요하다. OECD는 콩, 옥수수, 캐놀라 등 작물의 구성성분에 관한 기존 데이터를 요약한 일련의 합의문서(Consensus Documents) 시리즈를 발행하였는데, 제공되어 있는 성분이 제한적이며 현재 데이터를 반영하도록 쉽게 업데이트되지 않는 단점이 있다. 따라서 주요 상업작물의 상업품종들에 대한 성분분석 데이터베이스 구축 필요성이 제기되었다.
해외 작물 DB 현황
국제적으로 사용되고 있는 성분 DB로는 USDA, FAO, ILSI 등의 DB로써, FAO의 INFOODS(International Network of Food Data System), USDA 산하 NDL(Nutrient Data Laboratory) 및 National Nutrient Database, 캐나다의 Canadian Nutrient File(CF)등이 있다. 이 중에서 GM작물의 안전성 평가에서 상업품종의 자연변이로 인한 데이터 범주로 주로 사용되는 ILSI 작물성분 DB(ILSI-CCDB, ILSI Crop Composition Database)에 대해서 구체적으로 살펴보았다.
ILSI는 GM작물의 안전성 평가에서 환경 변이에 따른 작물성분의 변화를 이해하기 위하여 작물성분데이터를 공유하기로 합의한 6개의 농업생명공학 회사 대표들과 함께 작물성분 DB를 구축하기 시작하였다. 기존 상업작물 성분데이터를 수집하기 시작하여 2003년 작물성분 DB 버전1.0 (
농촌진흥청 국립농업과학원 ｢작물성분 DB｣ 구축과 이용
ILSI-CCDB는 전 세계의 연구 및 규제 과학자가 사용할 수 있는 빅데이터 정보 자원이다. 그러나 작물성분은 품종 및 수확 후 저장 조건을 포함한 재배 환경과 같은 다양한 요인에 의해 크게 영향을 받기 때문에(Yang et al. 2001; Reynolds et al. 2005; Harrigan et al. 2010; Privalle 2013; Oh et al. 2018), ILSI-CCDB와 OECD 문헌은 우리나라에서의 GM작물 안전성평가에 참고자료가 될 수 있지만, 직접적인 비교 자료로 쓰일 수 없다. 따라서 우리나라에서 전통적으로 재배하여 식용으로 사용되어 온 안전성이 보장되어 있는 작물품종들에 대한 지역별, 연차별 작물성분데이터가 필요하다. 국내 상업작물 품종들에 대한 성분분석 데이터에 대한 논문들이 일부 발표되어 있지만, 성분 프로파일링이 아니므로 안전성평가를 위한 자료로 활용하는데 한계가 있다. 벼의 경우, 쌀 품종별 영양성분과 항영양인자 등을 연구한 논문들이 발표되었다(Lee et al. 1988; Choe et al. 2002; Kim et al. 2004; Kyoun et al. 2006). 고추에 대해서는 품종별 파이토케미컬 분석, 재배지역에 따른 캡사이시노이드 함량, 품종별 재배년도와 재배지역별 캡사이시노이드와 유리당의 함량 특성 등에 대한 논문이 있다(Lee et al. 2013; Huang et al. 2014; Hwang et al. 2014). 그러나 논문에서 발표된 성분분석 항목들은 안전성 평가에서 OECD에서 제안한 과학적 근거로 사용할 수 있는 성분 항목들에 대하여는 매우 제한적이다. 따라서 국립농업과학원 생물안전성과에서는 GM작물의 안전성 평가를 위해 벼와 고추 등의 주요 작물들의 상업품종들을 여러 지역의 포장에서 2년 이상 재배하여 성분 분석할 시료를 수확·저장 후 분석 전문실험실에서 검증된 방법으로 분석한 데이터를 제공하는 ｢작물성분 DB｣를 구축하였다.
현재 ｢작물성분 DB｣에 제공되고 있는 작물들에 대한 정보를 Table 1과 Table 2에 요약하였다. 벼의 경우 2012년부터 2015년까지 자포니카 여러 품종을 수원과 군위, 전주, 천안 지역에서 포장 재배하여 수확, 건조 후 현미로 도정하여 쌀가루로 만든 후 바로 분석하거나 분석할 때까지 –70°C 냉동고에서 보관하였다. 벼 줄기는 사료용으로 사용되기 때문에 벼 줄기에서 영양성분을 분석하였다(2015년). 2014년과 2015년에는 자포니카 품종과 더불어 인디카와 통일계 품종을 재배 수확하여 현미로 가공한 후 성분을 분석하였다. 고추는 2016년과 2017년에 10가지 품종을 전북 임실과 경북 영양 지역에서 재배 건조한 후 저온에서 보관·분쇄한 후 분석할 때 까지 –70°C 냉동 보관하여 분석하였다. 콜리플라워와 고구마, 감자는 색이 다른 여러 품종들을 각각 2012년 대전과 2013년 무안, 2015년 평창에서 재배하여 수확 후 분석하였다.
-
Table 1 Location, year of field trials and rice varieties in Crop Composition DB
Cultivation year 2012 2013 2014 2015 Cultivation location Suwon, Gunwi Suwon Suwon Jeonju, Cheonan Sample tissue Grain Grain Grain Grain, Straw Rice type and cultivars Japonica GAM, ND, DJ, SDJ, IM, IP, CN, CC KO, ND, NP, DA, SK, SHC, SB, AM, YA, OD, UK, CB, HAM, HS, HY KO, ND, NP, DA, SK, SHC, SB, AM, YA, OD, UK, CB, HAM, HS, HY KO, ND, NP, DA, SK, SHC, SB, AM, YA, OD, UK, CB, HAM, HS, HY Indica - - IR50, IR64, IR72, IR102 IR50, IR64, IR72, IR102 Tongil - - DS, AD, KS, HA DS, AD, KS, HA
-
Table 2 Location, year of field trials and varieties of capsicum, cauliflower, sweet potato and potato in Crop Composition DB
Crops Cultivation year Cultivation location Sample tissue Cultivars Capsicum 2016, 2017 Imsil, Youngyang Fruits BS, MC, HB, KKH, JJS, ASJ, PRJD, PRBB, PRSU, PRKS, PREV, MM Cauliflower 2012 Daejeon Flower Whiee Sails, Orbit, Cheddar, Craffiti Sweetpotato 2013 Muan Root YM, JHM, SJM Potato 2015 Pyeongchang Tube DS, HR, HY, JY
신뢰할 수 있는 데이터를 얻기 위하여 성분 분석은 AOAC, 식품공전, SCI급 논문에 발표된 검증된 방법들을 사용하여 실용화재단의 전문 분석실과 국립농업과학원 생물안전성과에서 진행되었다. 지금까지 벼, 고추, 고구마, 감자, 콜리플라워에 대한 성분함량 정보가 DB에 수록되었으며, 각각의 분석 항목들과 측정 단위는 Table 3과 같다. ｢작물성분 DB｣의 데이터 업로드는, 반복 분석한 데이터를 모두 업로드 하는 형식으로 제출되며, 데이터 출력시에는 평균값으로 생성되도록 하였다. 데이터 업로드 프로세스를 신속하고 정확하게 수행하기 위해 데이터 제출 형식이 표준화되었으며 수집된 데이터는 쉼표로 구분된 파일(.xls) 형식으로 제출되도록 하였다.
-
Table 3 Analyte Categories and Analytes for Crop Composition DB
Analyte category Analyte Units Crop types Proximate Carbohydrate (calculated) % DW Rice, capsicum Crude fiber % DW Rice, capsicum Starch % DW Rice, capsicum Soluble dietary fiber % DW Rice, capsicum Insoluble dietary fiber % DW Rice, capsicum Total dietary fiber % DW Rice, capsicum Moisture % DW Rice, capsicum Crude ash % DW Rice, capsicum Crude protein % DW Rice, capsicum Crude fat % DW Rice, capsicum Amino acid Cysteine % DW Rice, capsicum Glutamic acid % DW Rice, capsicum Glycine % DW Rice, capsicum Histidine % DW Rice, capsicum Isoleucine % DW Rice, capsicum Leucine % DW Rice, capsicum Lysine % DW Rice, capsicum Methionine % DW Rice, capsicum Phenylalanine % DW Rice, capsicum Proline % DW Rice, capsicum Serine % DW Rice, capsicum Threonine % DW Rice, capsicum Tryptophan % DW Rice, capsicum Tyrosine % DW Rice, capsicum Fatty acid Myristic acid (14:0) % total FA Rice, capsicum Palmitic acid (16:0) % total FA Rice, capsicum Stearic acid (18:0) % total FA Rice, capsicum Oleic acid (18:1) % total FA Rice, capsicum Arachidonic acid (20:0) % total FA Rice, capsicum Eicosenoic acid (20:1) % total FA Rice, capsicum Linolenic acid (18:3) % total FA Rice, capsicum Linoleic acid (18:2) % total FA Rice, capsicum Mineral Magnesium mg/g DW Rice, capsicum Phosphorus mg/g DW Rice, capsicum Potassium mg/g DW Rice, capsicum Sulfur mg/g DW Rice, capsicum Copper μg/g DW Rice, capsicum Iron μg/g DW Rice, capsicum Manganese μg/g DW Rice, capsicum Sodium μg/g DW Rice, capsicum Calcium mg/g DW Rice, capsicum Zinc μg/g DW Rice, capsicum Vitamin Vitamin B3 μg/g DW Rice, capsicum Vitamin B7 μg/g DW Rice, capsicum alpha-Tocopherol μg/g DW Rice, capsicum, potato Vitamin B1 μg/g DW Rice, capsicum Vitamin B2 μg/g DW Rice, capsicum Retinol μg/g DW Capsicum Vitamin B5 μg/g DW Capsicum Vitamin B6 μg/g DW Capsicum Vitamin B9 μg/g DW Capsicum Vitamin B12 μg/g DW Capsicum Vitamin C μg/g DW Capsicum Antinutrient Phytic acid % Rice Trypsin inhibitor TIU/mg Rice Phenolic Syringate μg/g DW Rice, cauliflower, sweetpotato Vanillate μg/g DW Rice, cauliflower, sweetpotato para-Coumarate μg/g DW Rice, cauliflower, sweetpotato Ferulate μg/g DW Rice, cauliflower, sweetpotato Sinapate μg/g DW Rice, cauliflower, sweetpotato para-Hydroxybenzoate μg/g DW Rice, cauliflower, sweetpotato Carotenoid Lutein μg/g DW Cauliflower, sweetpotato α-carotene μg/g DW Cauliflower, sweetpotato, capsicum β-carotene μg/g DW Cauliflower, sweetpotato, capsicum, potato Zeaxanthin μg/g DW Cauliflower, sweetpotato, capsicum, potato Antheraxanthin μg/g DW Potato Capsanthin μg/g DW Capsicum β-cryptoxanthin μg/g DW Capsicum Flavonoids Quercetin μg/g DW Sweetpotato Myricetin μg/g DW Sweetpotato Kaempferol μg/g DW Sweetpotato Luteolin μg/g DW Sweetpotato Policosanol Tetracosanol μg/g DW Potato Heneicosanol μg/g DW Potato Docosanol μg/g DW Potato Tricosanol μg/g DW Potato Hexacosanol μg/g DW Potato Heptacosanol μg/g DW Potato Octacosanol μg/g DW Potato Eicosanol μg/g DW Potato Tracontanol μg/g DW Potato Phytosterols Cholesterol μg/g DW Potato Stigmasterol μg/g DW Potato, capsicum beta-Sitosterol μg/g DW Potato, capsicum Campesterol μg/g DW Capsicum Free sugar Fructose % Capsicum Glucose % Capsicum Others Capsaicin μg/g Capsicum Dihydrocapsaicin μg/g Capsicum
국립농업과학원 웹사이트(
-
Fig. 1. Selection of criteria for Crop Composition Database search (
http://www.nass.go.kr/10_gmo/Gmo_CropLst.do )
Figure 2에 나타난 예시에서는 작물로 벼를 선택하고 조직으로 알곡, 가공형태로는 현미, 재배년도 2015, 재배지역 경기도, 품종으로 자포니카를 선택한 것이다. Figure 2에서 맨 위에 검색조건에 대한 정보가 나오며, DB에서 제공되고 있는 성분항목이 나타난다. 성분항목의 체크박스를 클릭하면 성분항목에 속한 세부성분, 샘플수, 최소값, 최대값, 평균값, 단위, 분석방법에 대한 정보를 간편 보기로 볼 수 있다. 검색결과는 엑셀파일로 제공되고 있다. 엑셀파일 아이콘을 클릭하면 파일을 다운로드 받을 수 있는데, 선택된 성분항목에 대한 자료만 제공되는 것이 아니라 분석된 모든 성분항목에 대한 자료가 제공되며, 분석 방법에 대한 참고문헌과 방법에 대한 상세한 정보가 적혀있다.
-
Fig. 2. Example of data output from Crop Composition Database search (
http://www.nass.go.kr/10_gmo/Gmo_CropLst.do )
｢작물성분 DB｣에서 제공하는 벼의 주요 성분데이터가 현재 GM작물의 안전성 평가에서 상업작물의 성분 비교 자료로써 활용되고 있는 OECD 합의문서(OECD 2016) 데이터와 ILSI-CCDB 데이터를 비교하여 보았다. ILSI-CCDB는 논벼에 대한 데이터만을 제공하기 때문에 현미의 성분을 제공하는 ｢작물성분 DB｣ 데이터와는 비교를 할 수 없었다. OECD 합의문서(2016)에는 식용을 위한 논벼와 현미 백미 등 가공형태와 배, 쌀겨 등 부위별 주요 성분데이터를 문헌과 ILSI- CCDB, USDA, NARO (National Agricultural Research Organization- Japan) 데이터베이스의 데이터를 Table로 정리하여 제공하고 있다. OECD 합의문서의 현미 성분 데이터들 중에서 가급적 최근에 발표되었으며, 분석된 성분의 항목들이 많은 NARO (2011) 데이터와 ｢작물성분 DB｣ 데이터를 비교하였다(Table 4). NARO (2011) 데이터는 1999년에서 2009년 사이에 일본의 주요 벼 품종에서 분석되었으며, 샘플은 138개이다. ｢작물성분 DB｣의 벼 시료에 대한 정보는 Table 1에 정리되어 있으며, 샘플 개수는 500이다. 두 데이터를 비교하였을 때 대부분의 분석 항목에서 ｢작물성분 DB｣의 평균값이 NARO (2011)보다 낮았으며, 이와 일치되게 최소값과 최대값이 낮았다. 특히 비타민 B3(니아신)은 ｢작물성분 DB｣의 최소･최대값이 현저히 낮아서 NARO (2011)의 최소･최대값 범위에 들어가지 않았다. 이러한 차이는 벼 품종과 현미로의 도정 정도의 차이, 재배 환경 등으로부터 발생하였을 수 있다. 이렇게 국가마다 가지고 있는 DB 빅데이터 정보로부터 작물 품종별, 재배정보별 등 환경요인에 의해 성분차이가 있는 것을 알 수 있다.
-
Table 4 Comparison of the representative brown rice data from NAAS Crop Composition DB and OECD Consensus Document
Componenta NAASb rangec NAAS mean OECD ranged OECD mean Proximates (% DW) Ash 0.78-2.04 1.172 1.2-1.7 1.5 Carbohydrate 79.9-92.9 88.882 85.2-88.9 87.5 Crude fat 0.97-2.79 1.707 2.8-3.9 3.3 Crude protein 4.56-8.92 5.81 6.5-10.0 7.7 Moisture 5.95-14 10.88 12.1-16.4 13.8 Amino acids (% DW) Alanine 0.24-0.51 0.329 0.37-0.59 0.45 Arginine 0.35-0.69 0.459 0.52-0.88 0.63 Aspartic Acid 0.39-1.04 0.517 0.59-0.96 0.71 Cysteine 0.11-0.21 0.139 0.15-0.28 0.2 Glutamic Acid 0.7-1.52 0.958 1.06-1.88 1.32 Glycine 0.20-0.39 0.269 0.32-0.48 0.37 Histidine 0.11-0.2 0.139 0.16-0.27 0.2 Isoleucine 0.14-0.31 0.196 0.22-0.40 0.29 Leucine 0.32-0.8 0.467 0.51-0.85 0.62 Lysine 0.17-0.38 0.222 0.26-0.40 0.3 Methionine 0.1-0.20 0.132 0.14-0.34 0.22 Fatty acids (% total FA) 14:0 Myristic 0.24-1.07 0.45 0.5-1.1 0.7 16:0 Palmitic 14.7-22.7 18.4 18.2-31.2 21.9 18:0 Stearic 1.7-5.4 2.5 1.5-2.8 2 18:1 Oleic 33.4-47.3 39.4 30.9-42.0 36.9 18:2 Linoleic 29.4-40.8 36.5 26.1-39.0 34.7 18:3 Linolenic 1.13-2.65 1.54 0.9-1.6 1.2 20:0 Arachidic 0.3-1.38 0.61 0.4-0.7 0.6 Vitamin (µg/g DW) Vitamin B1 (Thiamin) 0.47-5.46 3.478 3.6-8.1 5.1 Vitamin B2 (Riboflavin) 0.1-0.86 0.438 0.2-0.7 0.5 Vitamin B3 (Niacin) 1.61-22.8 9.9 50.4-134.7 79 Vitamin B7 (Biotin) 0.008-0.28 0.082 alpha-Tocopherol 2.21-99.3 28.1 8.9-21 14.9 aFor the units of measure: DW=dry weight, FA=fatty acids.
bNAAS: National Academy of Agricultural Sciences.
cData of brown rice was taken from the japonica type of Oryza sativa.
dData of brown rice was taken from NARO (2011) in OECD revised consensus document on compositional considerations for new varieties of rice (Oryza sativa).
GM작물에서 도입된 유전자의 영향에 의하여 발생할 수 있는 비의도적인 성분 변화를 조사하기 위한 방법들이 발전되고 있다. 현재까지는 GM작물의 안전성 평가법으로는 OECD의 가이드라인에 명시되어 있는 주요 영양성분과 항영양소, 독성물질, 이차대사 산물과 같은 알려진 성분을 비교작물과 비교하는 표적성분 접근법이 이용되고 있다. 그러나 표적성분 접근법은 분석 가능한 물질의 제한성과 알려지지 않은 항영양소나 독성물질 등을 확인할 수가 없다. 따라서 이를 보완하기 위하여 GM작물과 비교작물에서 전사체, 단백질체, 대사체 등의 프로파일링을 비교하는 비표적 성분 접근법이 발전되고 사용되고 있다(Ricroch et al. 2001; Ruebelt et al. 2006; Gong and Wang 2013). 그러나 작물에서 전사체와 단백질체, 대사체의 변화는 품종, 생장단계, 재배환경에 따라서 달라질 수 있다. 안전성평가에 프로파일링 데이터를 정확하게 이해하고 효과적으로 사용하기 위해서는 전사체, 단백질체, 대사체의 반복 실험과 통계분석, 생물학적 검증 등이 필요하며, 기존 상업작물의 자연적 변이 데이터가 축적되기까지 시간이 필요하다(Chassy 2010). 작물성분 DB의 구축과 확장은 향후 개발되는 새로운 생명공학 작물의 비의도적 변화를 좀 더 과학적으로 평가하기 위해, 표적 및 비표적 물질의 빅데이터를 프로파일링함으로써 GM작물의 안전성 평가에서 비교평가법으로 지속적으로 중요하게 활용되는 오픈소스가 될 것이다.
최근에 CRISPR 유전자편집기술이 적용된 작물의 경우 GMO규제 대상인지 아닌지 논란이 되고 있다. 외부 유전자를 식물의 유전체에 삽입시키지 않는다는 측면에서 GMO와 관련된 규제를 비켜나갈 수 있을 것이라는 기대가 높다(Ishii and Araki 2017). 실지로 미국은 CRISPR 유전자편집기술로 만든 갈변방지버섯은 기존의 유전자변형생물체와 달리 ‘transgene-free’이기 때문에 GMO규제 대상이 아니라고 허가하였으며, 이후 토마토, 옥수수 등의 다른 작물에서도 CRISPR 유전자편집기술이 적용되어 유전자단편이 존재하지 않는 경우 안전성 심사과정에서 제외되어 승인되었다(Lee 2018). 일본의 경우 미국과 유사하게 GMO작물 규제 대상에서 제외하는 방향을 추진하고 있다. 그러나 유럽연합(EU) 국가들과 뉴질랜드 등은 CRISPR 유전자편집 작물의 GMO 규제 대상 여부에 대한 찬반논리가 뜨거운 상태이다. 현재 우리나라는 CRISPR 유전자편집 작물 또한 ‘유전자변형생물체의 국가간 이동 등에 관한 법률’에 따르며 GMO와 같은 규제를 적용 받는다. 유전자편집 기술은 기존 육종기술에 비해 시간을 단축하며 새로운 형질들을 갖는 농산물들을 기대할 수 있는 획기적인 육종기술이다. 특히 가뭄과 더위 등 기후변화를 극복할 수 있는 작물의 개발, 질병 저항성, 수량 증대 등의 형질을 가진 작물들이 집중적으로 개발되고 있으며, 미국을 중심으로 곧 유전자편집 작물들이 국제 곡물시장에 출시될 것으로 전망된다(Lee 2018). 그러나 유전체 교정 과정의 부정확성 등 잠재적 위험 가능성 때문에 유전자편집 작물들의 안전성에 대한 우려도 제기되고 있다. 따라서 유전자편집 작물들이 향후 본격적으로 상업화될 경우 ｢작물성분 DB｣는 안전성 평가에서 중요한 자료가 될 것이다. 앞으로 수입 또는 국내에서 개발되어 재배될 가능성이 높은 생명공학 작물들의 상업화 품종들에 대한 성분분석 등으로 ｢작물성분 DB｣의 영역을 넓혀갈 필요가 있다. 그리고 성분 조회와 결과 옵션들을 사용자가 더 편리하고 효율적으로 사용할 수 있도록 데이터베이스 업그레이드가 이루어진다면 ｢작물성분 DB｣는 새로이 개발되는 작물 품종들의 안전성 평가에서 중요한 비교자료가 될 것이다. 또한 주요 작물 품종들의 재배지역과 재배연도에 따른 성분 조성을 비교하여 환경요인에 따른 품질 특성 등에 대한 중요한 정보를 제공할 것이라 기대된다.
국립농업과학원 생물안전성과는 생명공학기술로 개발되는 작물(GM작물)의 안전성 평가 중 ‘성분분석에 의한 비교 평가’에 참고자료로 활용할 수 있도록 기존 상업화 작물성분의 분석 데이터를 제공하는 ｢작물성분 DB｣를 구축하였다. ｢작물성분 DB｣는 우리나라의 자연 환경에서 재배되는 주요 작물 품종들의 영양성분 함량정보를 제공함으로써 품종과 재배 지역, 연도에 따라 함량의 변화 정도를 확인할 수 있도록 데이터를 업그레이드 하고 있다. 현재 2곳 이상의 재배지역에서 2년 이상 재배한 벼와 고추 시료에 대한 주요 영양분과 항영양소, 2차 대사산물을 검증된 분석 방법을 사용하여 분석한 데이트를 제공하고 있다. 데이터는 평균값과 최저, 최대값을 제공함으로써 GM작물의 안전성 평가시 GM작물과 대응 비교작물 간에 나타나는 통계적 차이가 기존 상업작물의 생물학적 차이 또는 허용범위 내에 속하는지를 평가할 수 있도록 하였다. ｢작물성분 DB｣는 사용자가 선택한 쿼리를 기반으로 쉽게 검색하고 활용하도록 하고 있다. 또한 유색미와 감자, 고구마, 콜리플라워와 같은 유색 작물의 기능성 성분 함량 정보를 제공하고 있어 일반 소비자들도 유용하게 정보를 활용할 수 있다. 본 논문은 상업작물 성분에 대한 중요한 정보를 제공하는 농진청 ｢작물성분 DB｣의 구성과 사용법을 소개하였다.
본 연구는 농촌진흥청 국립농업과학원의 기관고유 사업(과제번호: PJ013696)의 연구지원에 의해 수행되었음.
- Alba R, Phillips A, Mackie S, Gillikin N, Maxwell C, Brune P, Ridley W, Fitzpatrick J, Levine M, and Harris S. (2010) Improvements to the international life sciences institute crop composition database.
J Food Compos Anal 23 , 741-748.
- Aldemita RR, Reaño IME, Solis RO, and Hautea RA. (2015) Trends in global approvals of biotech crops (1992-2014).
GM Crops & Food 6 , 150-166.
- Brune PD, Culler AH, Ridley WP, and Walker K. (2013) Safety of GM crops: Compositional analysis.
J Agri Food Chem 61 , 8243-8247.
- Chassy BM. (2010) Can–omics inform a food safety assessment?.
Regul Toxicol Pharm 58 , S62-S70.
- Codex Alimentarius (2003a)
Principles for the risk analysis of foods derived from modern biotechnology; CAC/GL44-2003 - Codex Alimentarius (2003b)
Guideline for the conduct of food safety assessment of foods derived from recombinant-DNA plants; CAC/GL45-2003 . - Dunwell JM. (2014) Transgenic cereals: Current status and future prospects.
J Cereal Sci 59 , 419-434.
- EFSA (2010) EFSA Panel on genetically modified organisms (GMO). Scientific opinion on statistical considerations for the safety evaluation of GMOs.
EFSA J 8 , 1250-59pp. - EFSA (2011a) Guidance on selection of comparators for the risk assessment of genetically modified plants and derived food and feed.
EFSA J 9 , 2149.
- EFSA (2011b) Guidance for risk assessment of food and feed from genetically modified plants.
EFSA J 9 , 2150.
- EFSA (2011c) EFSA Panel on genetically modified organisms (GMO). Scientific opinon on guidance on selection of comparators for the risk assessment of genetically modified plants and derived food and feed.
EFSA J 9 , 2149-22pp. - Gong CY, and Wang T. (2013) Proteomic evaluation of genetically modified crops: current status and challenges.
Front Plant Sci 4 , 41.
- Harrigan GG, Glenn KC, and Ridley WP. (2010).
Assessing the natural variability in crop composition 58 , 513-520.
- Herman RA, and Price WD. (2013) Unintended compositional changes in genetically modified (GM) crops: 20 years of research.
J Agric Food Chem 61 , 11695-11701.
- Huang Y, So Y-J, Hwang JR, Yoo K-M, Lee K-W, Lee Y-J, and Hwang IK. (2014) Comparative studies on phytochemicals and bioactive activities in 24 new varieties of red pepper.
Korean J Food Sci Technol 46 , 395-403.
- Hwang IG, Yoo SM, and Lee J. (2014) Quality characteristics of red pepper cultivals according to cultivation years and regions.
Korean J Food & Nutr 27 , 817-825.
- ISAAA. 2017. Global Status of Commercialized Biotech/GM Crops in 2017: Biotech Crop Adoption Surges as Economic Benefits Accumulate in 22 Years.
ISAAA Brief No. 53 . ISAAA, Ithaca, NY. - Ishii T, and Araki M. (2017) A future scenario of the global regultory landscape regarding genome-edited crops.
GM Crops & Food 8 , 44-56.
- Johnson AAT, Kyriacou B, Callahan DL, Carruthers L, Stangoulis J, Lombi E, and Tester M. (2011) Constitutive overexpression of the OsNAS gene family reveals single-gene strategies for effective iron- and zinc-biofortification of rice endosperm.
PLOS One 6 , e24476.
- Kim M, Yang H-R, and Jeong Y. (2004) Mineral contents of brown and milled rice.
J Korean Sci Food Sci Nutr 33 , 443-446.
- Kok EJ, and Kuiper HA. (2003) Comparative safety assessment for biotech crops.
Trends in Biotechnol 21 , 439-444.
- Kyoun OY, Oh SH, Kim HY, Lee JH, Kim HC, Yoon WK, Kim HM, and Kim MR. (2006) Analyses of nutrients and antinutrients of rice cultivars.
Korean J Food Sci 22 , 949-956. - Lee H-J, Lee H-J, Byun S-M, and Kim H-S. (1988) Studies on the lipid content and neutral lipid composition of brown rice and milled rice.
Korean J Food Sci 20 , 585-593. - Lee S, Jeon US, Lee SJ, Kim YK, Persson DP, Husted S, Schjørring JK, Kakei Y, Masuda H, Nishizawa NK, and An G. (2009) Iron fortification of rice seeds through activation of the nicotianamine synthase gene.
Proc Natl Acad Sci USA 106 , 22014-22019.
- Lee S-E, Ham H, Kim Y, Sung J, Hwang I-G, Yu S-M, Jeong H-S, and Lee J. (2013) The content of capsaicinoids in peppers by cultivation region in Korea.
J Korean Sci Food Sci Nutr 42 , 129-133.
- Lee S-W. (2018) Strengthening the competitiveness of agricultural biotechnology through practical application of gene editing technology.
J Plant Biotechnol 45 , 155-170.
- OECD (1993).
Safety evaluation of foods derived by modern biotechnology; Concepts and Principles . Organization of Economic Cooperation and Development (OECD), Paris, France. - OECD (2012).
Revised consensus document on compositional consideration for new varieties of soyben [Glycine Max(L) Merr]: Key food and feed nutrients, anti-nutrients and other constituents . Organization for Economic Co-operation and Development, Paris. France. - OECD (2016).
Revised consensus document on compositional consideration for new varieties of rice ( Oryza Sativa ): Key food and feed nutrients, anti-nutrients and other constituents. Organization for Economic Co-operation and Development, Paris. France. - Oh S, Lee S, Park S, Lee S, Lee S, Cho H, Chung Y, and Park S. (2018) Statistical study on the environmental effects of nutritional components in rice varieties.
Food Sci Nutr , 1-10pp. https://doi.org/10.1002/fsn3.839
- Paine J, Shipton C, Chaggar S, Howells R, Kennedy M, Vernon G, Wright S, Hinchliffe E, Adams J, Silverstone A, and Drake R. (2005) Improving the nutritional value of golden rice through increased pro-vitamin A content.
Nat Biotechnol 23 , 482-487.
- Privalle LS. (2013) Bringing a transgenic crop to market: Where compositional analysis fits.
J Agric Food Chem 61 , 8260-8266.
- Reynolds TL, Nemeth MA, Glenn KC, Ridley WP, and Astwood JD. (2005) Natural variability of metabolites in maize grain: differences due to genetic background.
J Agric Food Chem 53 , 10061-10067.
- Ricroch AE, Bergé JB, and Kuntz M. (2001) Evaluation of Genetically Engineered Crops Using Transcriptomic, Proteomic, and Metabolomic Profiling Techniques.
Plant Physiol 155 , 1752-1761.
- Ridley WP, Shillito RD, Coats I, Steiner H-Y, Shawgo M, Phillips A, Dussold P, and Kurtyka L. (2004) Development of the international life sciences institute crop composition database.
J Food Compos Anal 17 , 423-438.
- Ruebelt MC, Leimgruber NK, Lipp M, Reynolds TL, Nemeth MA, Astwood JD, Engel KH, and Jany KD. (2006) Application of two-dimensional gel electrophoresis to interrogate alterations in the proteome of genetically modified crops. 1. Assessing analytical validation.
J Agric Food Chem 54 , 2154-2161.
- Sabalza M, Madeira L, van Dolleweerd C, Ma JK, Capell T, and Christou P. (2012) Functional characterization of the recombinant HIV-neutralizing monoclonal antibody 2F5 produced in maize seeds.
Plant Mol Biol 80 , 477-488.
- Sult T, Barthet VJ, Bennett L, Edwards A, Fast B, Gillikin N, Launis K, New S, Rogers-Szuma K, Sabbatini J, Srinivasan JR, Tilton GB, and Venkatesh TV. (2016) Report: Release of the international life sciences institute crop composition database version 5.
J Food Compos Anal 51 , 106-111.
- Yang CI, Yang SJ, Jeoung YP, Choi HC, and Shin YB. (2001) Genotype × Environmental interaction of rice yield in multi-location trials.
Korean J Crop Sci 46 , 453-458. - Ye X, Al-Babili S, Klöti A, Zhang J, Lucca P, Beyer P, and Potrykus I. (2000) Engineering the provitamin A (b-carotene) biosynthetic pathway into (carotenoid-free) rice endosperm.
Science 287 , 303-305.
- Zhang S, Haider I, Kohlen W, Jiang L, Bouwmeester H, Meijer AH, Schluepmann H, Liu CM, and Ouwerkerk PB. (2012) Function of the HD-Zip I gene Oshox22 in ABA-mediated drought and salt tolerances in rice.
Plant Mol Biol 80 , 571-585.
PDF
Standard view
Export citation
Share Article
Review
J Plant Biotechnol 2018; 45(4): 289-298
Published online December 31, 2018 https://doi.org/10.5010/JPB.2018.45.4.289
Copyright © The Korean Society of Plant Biotechnology.
새로운 생명공학작물 안전성 평가를 위한 작물 성분 DB 구축
김은하, 이성곤, 박수윤, 이상구, 오선우
국립농업과학원 생물안전성과
Development of the conventional crop composition database for new genetically engineered crop safety assessment
Eun-Ha Kim, Seong-Kon Lee, Soo-Yun Park, Sang-Gu Lee, and Seon-Woo Oh
National Institute of Agricultural Science, Rural Development Administration, 54874, 370, Nongsaengmyeong-ro, Wansan-gu, Jeonju-si, Jeollabuk-do, Republic of Korea
Correspondence to:e-mail: ohsw0507@korea.kr
This is an Open-Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution Non-Commercial License (http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0) which permits unrestricted non-commercial use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited.
Abstract
The Biosafety Division of the National Academy of Agricultural Science has developed a ‘Crop Composition DB’ that provides analytical data on commercialized crops. It can be used as a reference in the ‘Comparative Evaluation by Compositional Analysis’ for the safety assessment of genetically modified (GM) crops. This database provides the composition of crops cultivated in Korea, and thus upgrades the data to check the extent of changes in the compositional content depending on the cultivated area, varieties and year. The database is a compilation of data on the antioxidant, nutrient and secondary metabolite compositions of rice and capsicum grown in two or more cultivation areas for a period of more than two years. Data analysis was conducted under the guidelines of the Association of Official Analytical Chemists or methods previously reported on papers. The data was provided as average, minimum and maximum values to assess whether the statistical differences between the GM crops and comparative non-GM crops fall within the biological differences or tolerances of the existing commercial crops. The Crop Composition DB is an open-access source and is easy to access based on the query selected by the user. Moreover, functional ingredients of colored crops, such as potatoes, sweet potatoes and cauliflowers, were provided so that food information can be used and utilized by general consumers. This paper introduces the feature and usage of ‘Crop Composition DB’, which is a valuable tool for characterizing the composition of conventional crops.
Keywords: Crop composition data, Nutrients, Antinutrient, Rice, Capsicum
서언
농업생명공학 기술은 농업 관행에 따른 환경오염 감소와 인구 증가에 따른 식량자원보급 및 영양학적 불균형의 해소와 농민들의 사회 경제적 상황의 향상 등에 대한 가능성을 열어주는 지속적인 발전이 가능한 강력한 도구이다(Ridley et al. 2004). 생명공학 작물(Genetically Modified Crops, GMCs 또는 biotech crops)은 1994년 FlavrSavr 토마토로 처음으로 상업적으로 이용되기 시작하여 1995년-1996년 제초제 내성 및 해충 저항성 대두 및 옥수수 제품이 도입되었다. 이 후로 GM작물에 대한 수요가 증가하면서 GM작물의 재배를 승인하는 국가와 재배 승인되는 작물의 종류가 증가하였다(Aldemita 2015). 결과적으로 1996년 170만
형질전환으로 개발된 GM작물들은 상업화되기 전에 환경 및 인체에 대한 영향을 엄격하게 평가받는 심사절차 과정을 거친다. 안전성 평가의 원칙은 OECD (Organization for Economic Cooperation and Development)에서 처음 제출되었으며(1993), 이 내용은 2003년 국제식량농업기구(FAO)/세계보건기구(WHO)가 설립한 식품규격위원회(Codex)가 제안한 가이드라인을 따르고 있다. GM작물의 안전성 평가방법은 ‘실질적 동등성(substantial equivalence)’ 개념을 근거로 평가되고 있으며(Codex Alimentarius 2003a; 2003b), 이는 GM작물을 기존에 안전하게 사용되어져 온 부모계 또는 근동질유전계와 같은 대응작물(Non-GM comparator)과 전통적으로 재배되어 온 상용 품종과 비교하는 것이다(Kok and Kuiper 2003). 실질적 동등성에 의한 안전성 평가는 절대적 안전성을 의미하는 것은 아니지만 현재로서는 가장 합리적인 접근 방법으로 인정되고 있다. 평가항목으로는 도입된 유전자의 안전성과 이로부터 생산되는 단백질과 대사물질의 안전성, 표현형 및 농업 형질, 성분 분석, 알레르기, 독성, GM작물 재배의 환경 위해성 등이 있다. 성분분석 비교법은 외부 유전자의 도입과정 또는 형질전환 산물에 의한 대사과정의 변경을 통하여 비의도적으로 구성 성분에 변화를 일으켜 상업 작물과 비교하였을 때 잠재적 위해성을 일으킬 수 있다는 가능성으로 시작되었으며, 이후 안전성 평가 과정에서 중요한 토대가 되었다(Burne 2013; Herman and Price 2013).
본 논문은 생명공학 작물 안전성 평가 과정에서 성분분석 비교법에 대하여 알아보고, 이에 기존 상업작물 품종의 자연변이 평가의 근거 자료로 사용될 수 있는 성분분석 자료 확보 및 작물성분 데이터베이스(DB) 구축의 중요성을 강조, 이를 뒷받침하고자 해외의 DB 구축과 활용에 대해 조사하였다. 그리고 우리나라에서 GM작물의 안전성 평가에 활용될 수 있도록 2015년부터 농촌진흥청 국립농업과학원에서 개발한 벼와 고추 등 주요 작물들의 상업화된 품종 성분 DB를 소개하였다. 농촌진흥청 ｢작물성분 DB｣ 구성과 현재 정보가 제공되고 있는 작물성분 내용 및 DB사용법을 안내하고, 향후 DB 활용의 중요성을 제시하였다.
생명공학 작물의 안전성 평가를 위한 기존 상업작물 DB 개발의 필요성
주요성분 비교평가는 작물의 영양 조성에서 GM작물과 대응작물의 실질적 동등성을 가장 빠르고 정확하게, 직접적으로 비교평가하는 항목이다. OECD는 GM작물 안전성 평가에 필요한 분석기준을 정립하고 18개 작물별 분석 성분의 종류와 함량 범위에 대한 국제적인 합의문을 발간하였다. 주요성분 분석은 주요 생화학적 구성 요소의 정량적 측정에 초점이 맞춰져 있으며(OECD 2012; 2016), 이러한 구성 요소로는 지질과 단백질, 회분, 탄수화물, 섬유질로 구성된 일반성분과 아미노산, 지방산, 비타민, 미네랄과 같은 주요영양성분과 작물 특이적인 항영양소와 이차대사산물로써 표적성분에 대한 비교평가이다. 성분비교에 대한 요구 조건은 각 규제당국마다 차이가 있지만, 재배 년 수 및 재배 지역 수, 합당한 비교군, 분석 신뢰성, 통계분석, 그리고 일반재배 작물의 참고범위 정보를 제공하는 것이 일반적이다. 참고자료에 대한 정보는 주로 국제생명과학연구회(International Life Science Institute, ILSI) 작물성분 데이터 또는 전문저널지에 발표된 데이터로 제공할 수 있다. 특히 유럽식품안전청(European Food Safety Authority, EFSA)은 GM작물의 안전성 평가를 위하여 작물의 재배 방법과 재료의 수확, 비교 상업작물의 선정 조건, 통계분석 방법 등에 대한 구체적인 가이드라인을 제시하고 있다(EFSA 2010; 2011a; 2011b; 2011c).
성분 분석 비교법은 GM작물과 대응작물에 존재하는 성분을 비교하는 것으로, 두 작물에 함유된 어떤 성분이 통계학적으로 유의미한 차이가 없다면 GM작물에서 도입된 형질이 비의도적으로 의미 있는 영향을 미치지 않았다고 평가되며, 차후 그 성분에 대한 안전성 평가를 진행하지 않는다. 그러나 통계학적으로 유의미한 차이가 있다면, 두 작물간의 성분 차이가 작물 품종에서 발견되는 자연변이 범위 내에 속해있는지 평가한다. GM작물의 안전성 평가를 위한 기존 상업품종들의 성분데이터는 상업품종들을 GM작물, 대응작물과 함께 재배하여 분석하거나, 발표되어 있는 문헌의 자료나 데이터베이스를 이용한다. 따라서 GM작물의 성분이 상업작물의 자연 변이에 속하는지 비교하기 위하여 포괄적인 최신 성분데이터가 필요하다. OECD는 콩, 옥수수, 캐놀라 등 작물의 구성성분에 관한 기존 데이터를 요약한 일련의 합의문서(Consensus Documents) 시리즈를 발행하였는데, 제공되어 있는 성분이 제한적이며 현재 데이터를 반영하도록 쉽게 업데이트되지 않는 단점이 있다. 따라서 주요 상업작물의 상업품종들에 대한 성분분석 데이터베이스 구축 필요성이 제기되었다.
해외 작물 DB 현황
국제적으로 사용되고 있는 성분 DB로는 USDA, FAO, ILSI 등의 DB로써, FAO의 INFOODS(International Network of Food Data System), USDA 산하 NDL(Nutrient Data Laboratory) 및 National Nutrient Database, 캐나다의 Canadian Nutrient File(CF)등이 있다. 이 중에서 GM작물의 안전성 평가에서 상업품종의 자연변이로 인한 데이터 범주로 주로 사용되는 ILSI 작물성분 DB(ILSI-CCDB, ILSI Crop Composition Database)에 대해서 구체적으로 살펴보았다.
ILSI는 GM작물의 안전성 평가에서 환경 변이에 따른 작물성분의 변화를 이해하기 위하여 작물성분데이터를 공유하기로 합의한 6개의 농업생명공학 회사 대표들과 함께 작물성분 DB를 구축하기 시작하였다. 기존 상업작물 성분데이터를 수집하기 시작하여 2003년 작물성분 DB 버전1.0 (
농촌진흥청 국립농업과학원 ｢작물성분 DB｣ 구축과 이용
ILSI-CCDB는 전 세계의 연구 및 규제 과학자가 사용할 수 있는 빅데이터 정보 자원이다. 그러나 작물성분은 품종 및 수확 후 저장 조건을 포함한 재배 환경과 같은 다양한 요인에 의해 크게 영향을 받기 때문에(Yang et al. 2001; Reynolds et al. 2005; Harrigan et al. 2010; Privalle 2013; Oh et al. 2018), ILSI-CCDB와 OECD 문헌은 우리나라에서의 GM작물 안전성평가에 참고자료가 될 수 있지만, 직접적인 비교 자료로 쓰일 수 없다. 따라서 우리나라에서 전통적으로 재배하여 식용으로 사용되어 온 안전성이 보장되어 있는 작물품종들에 대한 지역별, 연차별 작물성분데이터가 필요하다. 국내 상업작물 품종들에 대한 성분분석 데이터에 대한 논문들이 일부 발표되어 있지만, 성분 프로파일링이 아니므로 안전성평가를 위한 자료로 활용하는데 한계가 있다. 벼의 경우, 쌀 품종별 영양성분과 항영양인자 등을 연구한 논문들이 발표되었다(Lee et al. 1988; Choe et al. 2002; Kim et al. 2004; Kyoun et al. 2006). 고추에 대해서는 품종별 파이토케미컬 분석, 재배지역에 따른 캡사이시노이드 함량, 품종별 재배년도와 재배지역별 캡사이시노이드와 유리당의 함량 특성 등에 대한 논문이 있다(Lee et al. 2013; Huang et al. 2014; Hwang et al. 2014). 그러나 논문에서 발표된 성분분석 항목들은 안전성 평가에서 OECD에서 제안한 과학적 근거로 사용할 수 있는 성분 항목들에 대하여는 매우 제한적이다. 따라서 국립농업과학원 생물안전성과에서는 GM작물의 안전성 평가를 위해 벼와 고추 등의 주요 작물들의 상업품종들을 여러 지역의 포장에서 2년 이상 재배하여 성분 분석할 시료를 수확·저장 후 분석 전문실험실에서 검증된 방법으로 분석한 데이터를 제공하는 ｢작물성분 DB｣를 구축하였다.
현재 ｢작물성분 DB｣에 제공되고 있는 작물들에 대한 정보를 Table 1과 Table 2에 요약하였다. 벼의 경우 2012년부터 2015년까지 자포니카 여러 품종을 수원과 군위, 전주, 천안 지역에서 포장 재배하여 수확, 건조 후 현미로 도정하여 쌀가루로 만든 후 바로 분석하거나 분석할 때까지 –70°C 냉동고에서 보관하였다. 벼 줄기는 사료용으로 사용되기 때문에 벼 줄기에서 영양성분을 분석하였다(2015년). 2014년과 2015년에는 자포니카 품종과 더불어 인디카와 통일계 품종을 재배 수확하여 현미로 가공한 후 성분을 분석하였다. 고추는 2016년과 2017년에 10가지 품종을 전북 임실과 경북 영양 지역에서 재배 건조한 후 저온에서 보관·분쇄한 후 분석할 때 까지 –70°C 냉동 보관하여 분석하였다. 콜리플라워와 고구마, 감자는 색이 다른 여러 품종들을 각각 2012년 대전과 2013년 무안, 2015년 평창에서 재배하여 수확 후 분석하였다.
-
Table 1 . Location, year of field trials and rice varieties in Crop Composition DB.
Cultivation year 2012 2013 2014 2015 Cultivation location Suwon, Gunwi Suwon Suwon Jeonju, Cheonan Sample tissue Grain Grain Grain Grain, Straw Rice type and cultivars Japonica GAM, ND, DJ, SDJ, IM, IP, CN, CC KO, ND, NP, DA, SK, SHC, SB, AM, YA, OD, UK, CB, HAM, HS, HY KO, ND, NP, DA, SK, SHC, SB, AM, YA, OD, UK, CB, HAM, HS, HY KO, ND, NP, DA, SK, SHC, SB, AM, YA, OD, UK, CB, HAM, HS, HY Indica - - IR50, IR64, IR72, IR102 IR50, IR64, IR72, IR102 Tongil - - DS, AD, KS, HA DS, AD, KS, HA
-
Table 2 . Location, year of field trials and varieties of capsicum, cauliflower, sweet potato and potato in Crop Composition DB.
Crops Cultivation year Cultivation location Sample tissue Cultivars Capsicum 2016, 2017 Imsil, Youngyang Fruits BS, MC, HB, KKH, JJS, ASJ, PRJD, PRBB, PRSU, PRKS, PREV, MM Cauliflower 2012 Daejeon Flower Whiee Sails, Orbit, Cheddar, Craffiti Sweetpotato 2013 Muan Root YM, JHM, SJM Potato 2015 Pyeongchang Tube DS, HR, HY, JY
신뢰할 수 있는 데이터를 얻기 위하여 성분 분석은 AOAC, 식품공전, SCI급 논문에 발표된 검증된 방법들을 사용하여 실용화재단의 전문 분석실과 국립농업과학원 생물안전성과에서 진행되었다. 지금까지 벼, 고추, 고구마, 감자, 콜리플라워에 대한 성분함량 정보가 DB에 수록되었으며, 각각의 분석 항목들과 측정 단위는 Table 3과 같다. ｢작물성분 DB｣의 데이터 업로드는, 반복 분석한 데이터를 모두 업로드 하는 형식으로 제출되며, 데이터 출력시에는 평균값으로 생성되도록 하였다. 데이터 업로드 프로세스를 신속하고 정확하게 수행하기 위해 데이터 제출 형식이 표준화되었으며 수집된 데이터는 쉼표로 구분된 파일(.xls) 형식으로 제출되도록 하였다.
-
Table 3 . Analyte Categories and Analytes for Crop Composition DB.
Analyte category Analyte Units Crop types Proximate Carbohydrate (calculated) % DW Rice, capsicum Crude fiber % DW Rice, capsicum Starch % DW Rice, capsicum Soluble dietary fiber % DW Rice, capsicum Insoluble dietary fiber % DW Rice, capsicum Total dietary fiber % DW Rice, capsicum Moisture % DW Rice, capsicum Crude ash % DW Rice, capsicum Crude protein % DW Rice, capsicum Crude fat % DW Rice, capsicum Amino acid Cysteine % DW Rice, capsicum Glutamic acid % DW Rice, capsicum Glycine % DW Rice, capsicum Histidine % DW Rice, capsicum Isoleucine % DW Rice, capsicum Leucine % DW Rice, capsicum Lysine % DW Rice, capsicum Methionine % DW Rice, capsicum Phenylalanine % DW Rice, capsicum Proline % DW Rice, capsicum Serine % DW Rice, capsicum Threonine % DW Rice, capsicum Tryptophan % DW Rice, capsicum Tyrosine % DW Rice, capsicum Fatty acid Myristic acid (14:0) % total FA Rice, capsicum Palmitic acid (16:0) % total FA Rice, capsicum Stearic acid (18:0) % total FA Rice, capsicum Oleic acid (18:1) % total FA Rice, capsicum Arachidonic acid (20:0) % total FA Rice, capsicum Eicosenoic acid (20:1) % total FA Rice, capsicum Linolenic acid (18:3) % total FA Rice, capsicum Linoleic acid (18:2) % total FA Rice, capsicum Mineral Magnesium mg/g DW Rice, capsicum Phosphorus mg/g DW Rice, capsicum Potassium mg/g DW Rice, capsicum Sulfur mg/g DW Rice, capsicum Copper μg/g DW Rice, capsicum Iron μg/g DW Rice, capsicum Manganese μg/g DW Rice, capsicum Sodium μg/g DW Rice, capsicum Calcium mg/g DW Rice, capsicum Zinc μg/g DW Rice, capsicum Vitamin Vitamin B3 μg/g DW Rice, capsicum Vitamin B7 μg/g DW Rice, capsicum alpha-Tocopherol μg/g DW Rice, capsicum, potato Vitamin B1 μg/g DW Rice, capsicum Vitamin B2 μg/g DW Rice, capsicum Retinol μg/g DW Capsicum Vitamin B5 μg/g DW Capsicum Vitamin B6 μg/g DW Capsicum Vitamin B9 μg/g DW Capsicum Vitamin B12 μg/g DW Capsicum Vitamin C μg/g DW Capsicum Antinutrient Phytic acid % Rice Trypsin inhibitor TIU/mg Rice Phenolic Syringate μg/g DW Rice, cauliflower, sweetpotato Vanillate μg/g DW Rice, cauliflower, sweetpotato para-Coumarate μg/g DW Rice, cauliflower, sweetpotato Ferulate μg/g DW Rice, cauliflower, sweetpotato Sinapate μg/g DW Rice, cauliflower, sweetpotato para-Hydroxybenzoate μg/g DW Rice, cauliflower, sweetpotato Carotenoid Lutein μg/g DW Cauliflower, sweetpotato α-carotene μg/g DW Cauliflower, sweetpotato, capsicum β-carotene μg/g DW Cauliflower, sweetpotato, capsicum, potato Zeaxanthin μg/g DW Cauliflower, sweetpotato, capsicum, potato Antheraxanthin μg/g DW Potato Capsanthin μg/g DW Capsicum β-cryptoxanthin μg/g DW Capsicum Flavonoids Quercetin μg/g DW Sweetpotato Myricetin μg/g DW Sweetpotato Kaempferol μg/g DW Sweetpotato Luteolin μg/g DW Sweetpotato Policosanol Tetracosanol μg/g DW Potato Heneicosanol μg/g DW Potato Docosanol μg/g DW Potato Tricosanol μg/g DW Potato Hexacosanol μg/g DW Potato Heptacosanol μg/g DW Potato Octacosanol μg/g DW Potato Eicosanol μg/g DW Potato Tracontanol μg/g DW Potato Phytosterols Cholesterol μg/g DW Potato Stigmasterol μg/g DW Potato, capsicum beta-Sitosterol μg/g DW Potato, capsicum Campesterol μg/g DW Capsicum Free sugar Fructose % Capsicum Glucose % Capsicum Others Capsaicin μg/g Capsicum Dihydrocapsaicin μg/g Capsicum
국립농업과학원 웹사이트(
-
Figure 1.
Selection of criteria for Crop Composition Database search (
http://www.nass.go.kr/10_gmo/Gmo_CropLst.do )
Figure 2에 나타난 예시에서는 작물로 벼를 선택하고 조직으로 알곡, 가공형태로는 현미, 재배년도 2015, 재배지역 경기도, 품종으로 자포니카를 선택한 것이다. Figure 2에서 맨 위에 검색조건에 대한 정보가 나오며, DB에서 제공되고 있는 성분항목이 나타난다. 성분항목의 체크박스를 클릭하면 성분항목에 속한 세부성분, 샘플수, 최소값, 최대값, 평균값, 단위, 분석방법에 대한 정보를 간편 보기로 볼 수 있다. 검색결과는 엑셀파일로 제공되고 있다. 엑셀파일 아이콘을 클릭하면 파일을 다운로드 받을 수 있는데, 선택된 성분항목에 대한 자료만 제공되는 것이 아니라 분석된 모든 성분항목에 대한 자료가 제공되며, 분석 방법에 대한 참고문헌과 방법에 대한 상세한 정보가 적혀있다.
-
Figure 2.
Example of data output from Crop Composition Database search (
http://www.nass.go.kr/10_gmo/Gmo_CropLst.do )
｢작물성분 DB｣에서 제공하는 벼의 주요 성분데이터가 현재 GM작물의 안전성 평가에서 상업작물의 성분 비교 자료로써 활용되고 있는 OECD 합의문서(OECD 2016) 데이터와 ILSI-CCDB 데이터를 비교하여 보았다. ILSI-CCDB는 논벼에 대한 데이터만을 제공하기 때문에 현미의 성분을 제공하는 ｢작물성분 DB｣ 데이터와는 비교를 할 수 없었다. OECD 합의문서(2016)에는 식용을 위한 논벼와 현미 백미 등 가공형태와 배, 쌀겨 등 부위별 주요 성분데이터를 문헌과 ILSI- CCDB, USDA, NARO (National Agricultural Research Organization- Japan) 데이터베이스의 데이터를 Table로 정리하여 제공하고 있다. OECD 합의문서의 현미 성분 데이터들 중에서 가급적 최근에 발표되었으며, 분석된 성분의 항목들이 많은 NARO (2011) 데이터와 ｢작물성분 DB｣ 데이터를 비교하였다(Table 4). NARO (2011) 데이터는 1999년에서 2009년 사이에 일본의 주요 벼 품종에서 분석되었으며, 샘플은 138개이다. ｢작물성분 DB｣의 벼 시료에 대한 정보는 Table 1에 정리되어 있으며, 샘플 개수는 500이다. 두 데이터를 비교하였을 때 대부분의 분석 항목에서 ｢작물성분 DB｣의 평균값이 NARO (2011)보다 낮았으며, 이와 일치되게 최소값과 최대값이 낮았다. 특히 비타민 B3(니아신)은 ｢작물성분 DB｣의 최소･최대값이 현저히 낮아서 NARO (2011)의 최소･최대값 범위에 들어가지 않았다. 이러한 차이는 벼 품종과 현미로의 도정 정도의 차이, 재배 환경 등으로부터 발생하였을 수 있다. 이렇게 국가마다 가지고 있는 DB 빅데이터 정보로부터 작물 품종별, 재배정보별 등 환경요인에 의해 성분차이가 있는 것을 알 수 있다.
-
Table 4 . Comparison of the representative brown rice data from NAAS Crop Composition DB and OECD Consensus Document.
Componenta NAASb rangec NAAS mean OECD ranged OECD mean Proximates (% DW) Ash 0.78-2.04 1.172 1.2-1.7 1.5 Carbohydrate 79.9-92.9 88.882 85.2-88.9 87.5 Crude fat 0.97-2.79 1.707 2.8-3.9 3.3 Crude protein 4.56-8.92 5.81 6.5-10.0 7.7 Moisture 5.95-14 10.88 12.1-16.4 13.8 Amino acids (% DW) Alanine 0.24-0.51 0.329 0.37-0.59 0.45 Arginine 0.35-0.69 0.459 0.52-0.88 0.63 Aspartic Acid 0.39-1.04 0.517 0.59-0.96 0.71 Cysteine 0.11-0.21 0.139 0.15-0.28 0.2 Glutamic Acid 0.7-1.52 0.958 1.06-1.88 1.32 Glycine 0.20-0.39 0.269 0.32-0.48 0.37 Histidine 0.11-0.2 0.139 0.16-0.27 0.2 Isoleucine 0.14-0.31 0.196 0.22-0.40 0.29 Leucine 0.32-0.8 0.467 0.51-0.85 0.62 Lysine 0.17-0.38 0.222 0.26-0.40 0.3 Methionine 0.1-0.20 0.132 0.14-0.34 0.22 Fatty acids (% total FA) 14:0 Myristic 0.24-1.07 0.45 0.5-1.1 0.7 16:0 Palmitic 14.7-22.7 18.4 18.2-31.2 21.9 18:0 Stearic 1.7-5.4 2.5 1.5-2.8 2 18:1 Oleic 33.4-47.3 39.4 30.9-42.0 36.9 18:2 Linoleic 29.4-40.8 36.5 26.1-39.0 34.7 18:3 Linolenic 1.13-2.65 1.54 0.9-1.6 1.2 20:0 Arachidic 0.3-1.38 0.61 0.4-0.7 0.6 Vitamin (µg/g DW) Vitamin B1 (Thiamin) 0.47-5.46 3.478 3.6-8.1 5.1 Vitamin B2 (Riboflavin) 0.1-0.86 0.438 0.2-0.7 0.5 Vitamin B3 (Niacin) 1.61-22.8 9.9 50.4-134.7 79 Vitamin B7 (Biotin) 0.008-0.28 0.082 alpha-Tocopherol 2.21-99.3 28.1 8.9-21 14.9 aFor the units of measure: DW=dry weight, FA=fatty acids.
bNAAS: National Academy of Agricultural Sciences.
cData of brown rice was taken from the japonica type of Oryza sativa.
dData of brown rice was taken from NARO (2011) in OECD revised consensus document on compositional considerations for new varieties of rice (Oryza sativa).
결론 및 전망
GM작물에서 도입된 유전자의 영향에 의하여 발생할 수 있는 비의도적인 성분 변화를 조사하기 위한 방법들이 발전되고 있다. 현재까지는 GM작물의 안전성 평가법으로는 OECD의 가이드라인에 명시되어 있는 주요 영양성분과 항영양소, 독성물질, 이차대사 산물과 같은 알려진 성분을 비교작물과 비교하는 표적성분 접근법이 이용되고 있다. 그러나 표적성분 접근법은 분석 가능한 물질의 제한성과 알려지지 않은 항영양소나 독성물질 등을 확인할 수가 없다. 따라서 이를 보완하기 위하여 GM작물과 비교작물에서 전사체, 단백질체, 대사체 등의 프로파일링을 비교하는 비표적 성분 접근법이 발전되고 사용되고 있다(Ricroch et al. 2001; Ruebelt et al. 2006; Gong and Wang 2013). 그러나 작물에서 전사체와 단백질체, 대사체의 변화는 품종, 생장단계, 재배환경에 따라서 달라질 수 있다. 안전성평가에 프로파일링 데이터를 정확하게 이해하고 효과적으로 사용하기 위해서는 전사체, 단백질체, 대사체의 반복 실험과 통계분석, 생물학적 검증 등이 필요하며, 기존 상업작물의 자연적 변이 데이터가 축적되기까지 시간이 필요하다(Chassy 2010). 작물성분 DB의 구축과 확장은 향후 개발되는 새로운 생명공학 작물의 비의도적 변화를 좀 더 과학적으로 평가하기 위해, 표적 및 비표적 물질의 빅데이터를 프로파일링함으로써 GM작물의 안전성 평가에서 비교평가법으로 지속적으로 중요하게 활용되는 오픈소스가 될 것이다.
최근에 CRISPR 유전자편집기술이 적용된 작물의 경우 GMO규제 대상인지 아닌지 논란이 되고 있다. 외부 유전자를 식물의 유전체에 삽입시키지 않는다는 측면에서 GMO와 관련된 규제를 비켜나갈 수 있을 것이라는 기대가 높다(Ishii and Araki 2017). 실지로 미국은 CRISPR 유전자편집기술로 만든 갈변방지버섯은 기존의 유전자변형생물체와 달리 ‘transgene-free’이기 때문에 GMO규제 대상이 아니라고 허가하였으며, 이후 토마토, 옥수수 등의 다른 작물에서도 CRISPR 유전자편집기술이 적용되어 유전자단편이 존재하지 않는 경우 안전성 심사과정에서 제외되어 승인되었다(Lee 2018). 일본의 경우 미국과 유사하게 GMO작물 규제 대상에서 제외하는 방향을 추진하고 있다. 그러나 유럽연합(EU) 국가들과 뉴질랜드 등은 CRISPR 유전자편집 작물의 GMO 규제 대상 여부에 대한 찬반논리가 뜨거운 상태이다. 현재 우리나라는 CRISPR 유전자편집 작물 또한 ‘유전자변형생물체의 국가간 이동 등에 관한 법률’에 따르며 GMO와 같은 규제를 적용 받는다. 유전자편집 기술은 기존 육종기술에 비해 시간을 단축하며 새로운 형질들을 갖는 농산물들을 기대할 수 있는 획기적인 육종기술이다. 특히 가뭄과 더위 등 기후변화를 극복할 수 있는 작물의 개발, 질병 저항성, 수량 증대 등의 형질을 가진 작물들이 집중적으로 개발되고 있으며, 미국을 중심으로 곧 유전자편집 작물들이 국제 곡물시장에 출시될 것으로 전망된다(Lee 2018). 그러나 유전체 교정 과정의 부정확성 등 잠재적 위험 가능성 때문에 유전자편집 작물들의 안전성에 대한 우려도 제기되고 있다. 따라서 유전자편집 작물들이 향후 본격적으로 상업화될 경우 ｢작물성분 DB｣는 안전성 평가에서 중요한 자료가 될 것이다. 앞으로 수입 또는 국내에서 개발되어 재배될 가능성이 높은 생명공학 작물들의 상업화 품종들에 대한 성분분석 등으로 ｢작물성분 DB｣의 영역을 넓혀갈 필요가 있다. 그리고 성분 조회와 결과 옵션들을 사용자가 더 편리하고 효율적으로 사용할 수 있도록 데이터베이스 업그레이드가 이루어진다면 ｢작물성분 DB｣는 새로이 개발되는 작물 품종들의 안전성 평가에서 중요한 비교자료가 될 것이다. 또한 주요 작물 품종들의 재배지역과 재배연도에 따른 성분 조성을 비교하여 환경요인에 따른 품질 특성 등에 대한 중요한 정보를 제공할 것이라 기대된다.
적요
국립농업과학원 생물안전성과는 생명공학기술로 개발되는 작물(GM작물)의 안전성 평가 중 ‘성분분석에 의한 비교 평가’에 참고자료로 활용할 수 있도록 기존 상업화 작물성분의 분석 데이터를 제공하는 ｢작물성분 DB｣를 구축하였다. ｢작물성분 DB｣는 우리나라의 자연 환경에서 재배되는 주요 작물 품종들의 영양성분 함량정보를 제공함으로써 품종과 재배 지역, 연도에 따라 함량의 변화 정도를 확인할 수 있도록 데이터를 업그레이드 하고 있다. 현재 2곳 이상의 재배지역에서 2년 이상 재배한 벼와 고추 시료에 대한 주요 영양분과 항영양소, 2차 대사산물을 검증된 분석 방법을 사용하여 분석한 데이트를 제공하고 있다. 데이터는 평균값과 최저, 최대값을 제공함으로써 GM작물의 안전성 평가시 GM작물과 대응 비교작물 간에 나타나는 통계적 차이가 기존 상업작물의 생물학적 차이 또는 허용범위 내에 속하는지를 평가할 수 있도록 하였다. ｢작물성분 DB｣는 사용자가 선택한 쿼리를 기반으로 쉽게 검색하고 활용하도록 하고 있다. 또한 유색미와 감자, 고구마, 콜리플라워와 같은 유색 작물의 기능성 성분 함량 정보를 제공하고 있어 일반 소비자들도 유용하게 정보를 활용할 수 있다. 본 논문은 상업작물 성분에 대한 중요한 정보를 제공하는 농진청 ｢작물성분 DB｣의 구성과 사용법을 소개하였다.
사사
본 연구는 농촌진흥청 국립농업과학원의 기관고유 사업(과제번호: PJ013696)의 연구지원에 의해 수행되었음.
Fig 1.
Download
Selection of criteria for Crop Composition Database search (
Fig 2.
Download
Example of data output from Crop Composition Database search (
-
Table 1 . Location, year of field trials and rice varieties in Crop Composition DB.
Cultivation year 2012 2013 2014 2015 Cultivation location Suwon, Gunwi Suwon Suwon Jeonju, Cheonan Sample tissue Grain Grain Grain Grain, Straw Rice type and cultivars Japonica GAM, ND, DJ, SDJ, IM, IP, CN, CC KO, ND, NP, DA, SK, SHC, SB, AM, YA, OD, UK, CB, HAM, HS, HY KO, ND, NP, DA, SK, SHC, SB, AM, YA, OD, UK, CB, HAM, HS, HY KO, ND, NP, DA, SK, SHC, SB, AM, YA, OD, UK, CB, HAM, HS, HY Indica - - IR50, IR64, IR72, IR102 IR50, IR64, IR72, IR102 Tongil - - DS, AD, KS, HA DS, AD, KS, HA
-
Table 2 . Location, year of field trials and varieties of capsicum, cauliflower, sweet potato and potato in Crop Composition DB.
Crops Cultivation year Cultivation location Sample tissue Cultivars Capsicum 2016, 2017 Imsil, Youngyang Fruits BS, MC, HB, KKH, JJS, ASJ, PRJD, PRBB, PRSU, PRKS, PREV, MM Cauliflower 2012 Daejeon Flower Whiee Sails, Orbit, Cheddar, Craffiti Sweetpotato 2013 Muan Root YM, JHM, SJM Potato 2015 Pyeongchang Tube DS, HR, HY, JY
-
Table 3 . Analyte Categories and Analytes for Crop Composition DB.
Analyte category Analyte Units Crop types Proximate Carbohydrate (calculated) % DW Rice, capsicum Crude fiber % DW Rice, capsicum Starch % DW Rice, capsicum Soluble dietary fiber % DW Rice, capsicum Insoluble dietary fiber % DW Rice, capsicum Total dietary fiber % DW Rice, capsicum Moisture % DW Rice, capsicum Crude ash % DW Rice, capsicum Crude protein % DW Rice, capsicum Crude fat % DW Rice, capsicum Amino acid Cysteine % DW Rice, capsicum Glutamic acid % DW Rice, capsicum Glycine % DW Rice, capsicum Histidine % DW Rice, capsicum Isoleucine % DW Rice, capsicum Leucine % DW Rice, capsicum Lysine % DW Rice, capsicum Methionine % DW Rice, capsicum Phenylalanine % DW Rice, capsicum Proline % DW Rice, capsicum Serine % DW Rice, capsicum Threonine % DW Rice, capsicum Tryptophan % DW Rice, capsicum Tyrosine % DW Rice, capsicum Fatty acid Myristic acid (14:0) % total FA Rice, capsicum Palmitic acid (16:0) % total FA Rice, capsicum Stearic acid (18:0) % total FA Rice, capsicum Oleic acid (18:1) % total FA Rice, capsicum Arachidonic acid (20:0) % total FA Rice, capsicum Eicosenoic acid (20:1) % total FA Rice, capsicum Linolenic acid (18:3) % total FA Rice, capsicum Linoleic acid (18:2) % total FA Rice, capsicum Mineral Magnesium mg/g DW Rice, capsicum Phosphorus mg/g DW Rice, capsicum Potassium mg/g DW Rice, capsicum Sulfur mg/g DW Rice, capsicum Copper μg/g DW Rice, capsicum Iron μg/g DW Rice, capsicum Manganese μg/g DW Rice, capsicum Sodium μg/g DW Rice, capsicum Calcium mg/g DW Rice, capsicum Zinc μg/g DW Rice, capsicum Vitamin Vitamin B3 μg/g DW Rice, capsicum Vitamin B7 μg/g DW Rice, capsicum alpha-Tocopherol μg/g DW Rice, capsicum, potato Vitamin B1 μg/g DW Rice, capsicum Vitamin B2 μg/g DW Rice, capsicum Retinol μg/g DW Capsicum Vitamin B5 μg/g DW Capsicum Vitamin B6 μg/g DW Capsicum Vitamin B9 μg/g DW Capsicum Vitamin B12 μg/g DW Capsicum Vitamin C μg/g DW Capsicum Antinutrient Phytic acid % Rice Trypsin inhibitor TIU/mg Rice Phenolic Syringate μg/g DW Rice, cauliflower, sweetpotato Vanillate μg/g DW Rice, cauliflower, sweetpotato para-Coumarate μg/g DW Rice, cauliflower, sweetpotato Ferulate μg/g DW Rice, cauliflower, sweetpotato Sinapate μg/g DW Rice, cauliflower, sweetpotato para-Hydroxybenzoate μg/g DW Rice, cauliflower, sweetpotato Carotenoid Lutein μg/g DW Cauliflower, sweetpotato α-carotene μg/g DW Cauliflower, sweetpotato, capsicum β-carotene μg/g DW Cauliflower, sweetpotato, capsicum, potato Zeaxanthin μg/g DW Cauliflower, sweetpotato, capsicum, potato Antheraxanthin μg/g DW Potato Capsanthin μg/g DW Capsicum β-cryptoxanthin μg/g DW Capsicum Flavonoids Quercetin μg/g DW Sweetpotato Myricetin μg/g DW Sweetpotato Kaempferol μg/g DW Sweetpotato Luteolin μg/g DW Sweetpotato Policosanol Tetracosanol μg/g DW Potato Heneicosanol μg/g DW Potato Docosanol μg/g DW Potato Tricosanol μg/g DW Potato Hexacosanol μg/g DW Potato Heptacosanol μg/g DW Potato Octacosanol μg/g DW Potato Eicosanol μg/g DW Potato Tracontanol μg/g DW Potato Phytosterols Cholesterol μg/g DW Potato Stigmasterol μg/g DW Potato, capsicum beta-Sitosterol μg/g DW Potato, capsicum Campesterol μg/g DW Capsicum Free sugar Fructose % Capsicum Glucose % Capsicum Others Capsaicin μg/g Capsicum Dihydrocapsaicin μg/g Capsicum
-
Table 4 . Comparison of the representative brown rice data from NAAS Crop Composition DB and OECD Consensus Document.
Componenta NAASb rangec NAAS mean OECD ranged OECD mean Proximates (% DW) Ash 0.78-2.04 1.172 1.2-1.7 1.5 Carbohydrate 79.9-92.9 88.882 85.2-88.9 87.5 Crude fat 0.97-2.79 1.707 2.8-3.9 3.3 Crude protein 4.56-8.92 5.81 6.5-10.0 7.7 Moisture 5.95-14 10.88 12.1-16.4 13.8 Amino acids (% DW) Alanine 0.24-0.51 0.329 0.37-0.59 0.45 Arginine 0.35-0.69 0.459 0.52-0.88 0.63 Aspartic Acid 0.39-1.04 0.517 0.59-0.96 0.71 Cysteine 0.11-0.21 0.139 0.15-0.28 0.2 Glutamic Acid 0.7-1.52 0.958 1.06-1.88 1.32 Glycine 0.20-0.39 0.269 0.32-0.48 0.37 Histidine 0.11-0.2 0.139 0.16-0.27 0.2 Isoleucine 0.14-0.31 0.196 0.22-0.40 0.29 Leucine 0.32-0.8 0.467 0.51-0.85 0.62 Lysine 0.17-0.38 0.222 0.26-0.40 0.3 Methionine 0.1-0.20 0.132 0.14-0.34 0.22 Fatty acids (% total FA) 14:0 Myristic 0.24-1.07 0.45 0.5-1.1 0.7 16:0 Palmitic 14.7-22.7 18.4 18.2-31.2 21.9 18:0 Stearic 1.7-5.4 2.5 1.5-2.8 2 18:1 Oleic 33.4-47.3 39.4 30.9-42.0 36.9 18:2 Linoleic 29.4-40.8 36.5 26.1-39.0 34.7 18:3 Linolenic 1.13-2.65 1.54 0.9-1.6 1.2 20:0 Arachidic 0.3-1.38 0.61 0.4-0.7 0.6 Vitamin (µg/g DW) Vitamin B1 (Thiamin) 0.47-5.46 3.478 3.6-8.1 5.1 Vitamin B2 (Riboflavin) 0.1-0.86 0.438 0.2-0.7 0.5 Vitamin B3 (Niacin) 1.61-22.8 9.9 50.4-134.7 79 Vitamin B7 (Biotin) 0.008-0.28 0.082 alpha-Tocopherol 2.21-99.3 28.1 8.9-21 14.9 aFor the units of measure: DW=dry weight, FA=fatty acids.
bNAAS: National Academy of Agricultural Sciences.
cData of brown rice was taken from the japonica type of Oryza sativa.
dData of brown rice was taken from NARO (2011) in OECD revised consensus document on compositional considerations for new varieties of rice (Oryza sativa).
References
- Alba R, Phillips A, Mackie S, Gillikin N, Maxwell C, Brune P, Ridley W, Fitzpatrick J, Levine M, and Harris S. (2010) Improvements to the international life sciences institute crop composition database.
J Food Compos Anal 23 , 741-748.
- Aldemita RR, Reaño IME, Solis RO, and Hautea RA. (2015) Trends in global approvals of biotech crops (1992-2014).
GM Crops & Food 6 , 150-166.
- Brune PD, Culler AH, Ridley WP, and Walker K. (2013) Safety of GM crops: Compositional analysis.
J Agri Food Chem 61 , 8243-8247.
- Chassy BM. (2010) Can–omics inform a food safety assessment?.
Regul Toxicol Pharm 58 , S62-S70.
- Codex Alimentarius (2003a)
Principles for the risk analysis of foods derived from modern biotechnology; CAC/GL44-2003 - Codex Alimentarius (2003b)
Guideline for the conduct of food safety assessment of foods derived from recombinant-DNA plants; CAC/GL45-2003 . - Dunwell JM. (2014) Transgenic cereals: Current status and future prospects.
J Cereal Sci 59 , 419-434.
- EFSA (2010) EFSA Panel on genetically modified organisms (GMO). Scientific opinion on statistical considerations for the safety evaluation of GMOs.
EFSA J 8 , 1250-59pp. - EFSA (2011a) Guidance on selection of comparators for the risk assessment of genetically modified plants and derived food and feed.
EFSA J 9 , 2149.
- EFSA (2011b) Guidance for risk assessment of food and feed from genetically modified plants.
EFSA J 9 , 2150.
- EFSA (2011c) EFSA Panel on genetically modified organisms (GMO). Scientific opinon on guidance on selection of comparators for the risk assessment of genetically modified plants and derived food and feed.
EFSA J 9 , 2149-22pp. - Gong CY, and Wang T. (2013) Proteomic evaluation of genetically modified crops: current status and challenges.
Front Plant Sci 4 , 41.
- Harrigan GG, Glenn KC, and Ridley WP. (2010).
Assessing the natural variability in crop composition 58 , 513-520.
- Herman RA, and Price WD. (2013) Unintended compositional changes in genetically modified (GM) crops: 20 years of research.
J Agric Food Chem 61 , 11695-11701.
- Huang Y, So Y-J, Hwang JR, Yoo K-M, Lee K-W, Lee Y-J, and Hwang IK. (2014) Comparative studies on phytochemicals and bioactive activities in 24 new varieties of red pepper.
Korean J Food Sci Technol 46 , 395-403.
- Hwang IG, Yoo SM, and Lee J. (2014) Quality characteristics of red pepper cultivals according to cultivation years and regions.
Korean J Food & Nutr 27 , 817-825.
- ISAAA. 2017. Global Status of Commercialized Biotech/GM Crops in 2017: Biotech Crop Adoption Surges as Economic Benefits Accumulate in 22 Years.
ISAAA Brief No. 53 . ISAAA, Ithaca, NY. - Ishii T, and Araki M. (2017) A future scenario of the global regultory landscape regarding genome-edited crops.
GM Crops & Food 8 , 44-56.
- Johnson AAT, Kyriacou B, Callahan DL, Carruthers L, Stangoulis J, Lombi E, and Tester M. (2011) Constitutive overexpression of the OsNAS gene family reveals single-gene strategies for effective iron- and zinc-biofortification of rice endosperm.
PLOS One 6 , e24476.
- Kim M, Yang H-R, and Jeong Y. (2004) Mineral contents of brown and milled rice.
J Korean Sci Food Sci Nutr 33 , 443-446.
- Kok EJ, and Kuiper HA. (2003) Comparative safety assessment for biotech crops.
Trends in Biotechnol 21 , 439-444.
- Kyoun OY, Oh SH, Kim HY, Lee JH, Kim HC, Yoon WK, Kim HM, and Kim MR. (2006) Analyses of nutrients and antinutrients of rice cultivars.
Korean J Food Sci 22 , 949-956. - Lee H-J, Lee H-J, Byun S-M, and Kim H-S. (1988) Studies on the lipid content and neutral lipid composition of brown rice and milled rice.
Korean J Food Sci 20 , 585-593. - Lee S, Jeon US, Lee SJ, Kim YK, Persson DP, Husted S, Schjørring JK, Kakei Y, Masuda H, Nishizawa NK, and An G. (2009) Iron fortification of rice seeds through activation of the nicotianamine synthase gene.
Proc Natl Acad Sci USA 106 , 22014-22019.
- Lee S-E, Ham H, Kim Y, Sung J, Hwang I-G, Yu S-M, Jeong H-S, and Lee J. (2013) The content of capsaicinoids in peppers by cultivation region in Korea.
J Korean Sci Food Sci Nutr 42 , 129-133.
- Lee S-W. (2018) Strengthening the competitiveness of agricultural biotechnology through practical application of gene editing technology.
J Plant Biotechnol 45 , 155-170.
- OECD (1993).
Safety evaluation of foods derived by modern biotechnology; Concepts and Principles . Organization of Economic Cooperation and Development (OECD), Paris, France. - OECD (2012).
Revised consensus document on compositional consideration for new varieties of soyben [Glycine Max(L) Merr]: Key food and feed nutrients, anti-nutrients and other constituents . Organization for Economic Co-operation and Development, Paris. France. - OECD (2016).
Revised consensus document on compositional consideration for new varieties of rice ( Oryza Sativa ): Key food and feed nutrients, anti-nutrients and other constituents. Organization for Economic Co-operation and Development, Paris. France. - Oh S, Lee S, Park S, Lee S, Lee S, Cho H, Chung Y, and Park S. (2018) Statistical study on the environmental effects of nutritional components in rice varieties.
Food Sci Nutr , 1-10pp. https://doi.org/10.1002/fsn3.839
- Paine J, Shipton C, Chaggar S, Howells R, Kennedy M, Vernon G, Wright S, Hinchliffe E, Adams J, Silverstone A, and Drake R. (2005) Improving the nutritional value of golden rice through increased pro-vitamin A content.
Nat Biotechnol 23 , 482-487.
- Privalle LS. (2013) Bringing a transgenic crop to market: Where compositional analysis fits.
J Agric Food Chem 61 , 8260-8266.
- Reynolds TL, Nemeth MA, Glenn KC, Ridley WP, and Astwood JD. (2005) Natural variability of metabolites in maize grain: differences due to genetic background.
J Agric Food Chem 53 , 10061-10067.
- Ricroch AE, Bergé JB, and Kuntz M. (2001) Evaluation of Genetically Engineered Crops Using Transcriptomic, Proteomic, and Metabolomic Profiling Techniques.
Plant Physiol 155 , 1752-1761.
- Ridley WP, Shillito RD, Coats I, Steiner H-Y, Shawgo M, Phillips A, Dussold P, and Kurtyka L. (2004) Development of the international life sciences institute crop composition database.
J Food Compos Anal 17 , 423-438.
- Ruebelt MC, Leimgruber NK, Lipp M, Reynolds TL, Nemeth MA, Astwood JD, Engel KH, and Jany KD. (2006) Application of two-dimensional gel electrophoresis to interrogate alterations in the proteome of genetically modified crops. 1. Assessing analytical validation.
J Agric Food Chem 54 , 2154-2161.
- Sabalza M, Madeira L, van Dolleweerd C, Ma JK, Capell T, and Christou P. (2012) Functional characterization of the recombinant HIV-neutralizing monoclonal antibody 2F5 produced in maize seeds.
Plant Mol Biol 80 , 477-488.
- Sult T, Barthet VJ, Bennett L, Edwards A, Fast B, Gillikin N, Launis K, New S, Rogers-Szuma K, Sabbatini J, Srinivasan JR, Tilton GB, and Venkatesh TV. (2016) Report: Release of the international life sciences institute crop composition database version 5.
J Food Compos Anal 51 , 106-111.
- Yang CI, Yang SJ, Jeoung YP, Choi HC, and Shin YB. (2001) Genotype × Environmental interaction of rice yield in multi-location trials.
Korean J Crop Sci 46 , 453-458. - Ye X, Al-Babili S, Klöti A, Zhang J, Lucca P, Beyer P, and Potrykus I. (2000) Engineering the provitamin A (b-carotene) biosynthetic pathway into (carotenoid-free) rice endosperm.
Science 287 , 303-305.
- Zhang S, Haider I, Kohlen W, Jiang L, Bouwmeester H, Meijer AH, Schluepmann H, Liu CM, and Ouwerkerk PB. (2012) Function of the HD-Zip I gene Oshox22 in ABA-mediated drought and salt tolerances in rice.
Plant Mol Biol 80 , 571-585.
.jpg)
Article Tools
Stats or Metrics
Share this article on
Related articles in JPB
-
Comparative analysis of data processing methods for optimizing timeseries analysis of rice plant height
Do-Sin Lee · Dong-Young Kim · Kwang-Hyun Jo · Jeong-Ho Baek · Sung-Hwan Jo
J Plant Biotechnol 2024; 51(1): 344-353 -
Comparative analysis of data processing methods for optimizing time-series analysis of rice plant height
Do-Sin Lee , Dong-Young Kim , Kwang-Hyun Jo , Jeong-Ho Baek , Sung-Hwan Jo
J Plant Biotechnol -0001; (): -
Methods for environmental risk assessment of rice transgenic plants expressing small non-coding RNA
Byung Jun Jin · Hyun Jin Chun · Hyun Min Cho · Su Hyeon Lee · Cheol Woo Choi · Wook-Hun Jung · Dongwon Baek · Chang-deok Han · Min Chul Kim
J Plant Biotechnol 2019; 46(3): 205-216
